ویژگی دارویی و بخش های فعال بادرنجبویه دنایی و اهمیت ان در ایران : یک مطالعه اصولی

Medicinal Properties and Active Constituents of Dracocephalum kotschyi and Its Significance in Iran: A Systematic Review

چكيده

مقدمه

مواد و روش ها

طرح مطالعه

معیارهای ورود و خروج

انتخاب مقاله مطالعه

نتایج

مقالات موجود در بررسی و توزیع جغرافیایی

بحث و بررسی

کاربرد بادرنجبویه دنایی به عنوان یک داروی سنتی

اجزای فعال بادرنجبویه دنایی

خواص دارویی بادرنجبویه دنایی و عملکرد آن ها

فعالیت آنتی اکسیدانی

فعالیت ضد سرطانی بادرنجبویه دنایی

اثرات بادرنجبویه دنایی بر سلول های تومور

اثرات بادرنجبویه دنایی بر آنژیوژنز

تاثیر بادرنجبویه دنایی بر آنکوژنزیز سلولی

تاثیر بادرنجبویه دنایی بر مسیر های PI3K/Akt

تاثیر بادرنجبویه دنایی بر عامل NF-?B

بادرنجبویه دنایی به عنوان ضد التهاب

فعالیت های ضد دیابت

خواص ضد میکروبی بادرنجبویه دنایی

اثر التیام زخم

سایر خواص دارویی

نتیجه گیری

اختصارات

نکات

اهداف: زرين گياه داراي بيش از 60 گونه است و عمدتا در مناطق معتدل آسيا و اروپا یافت می شود. یکی از این گونه ها که بادرنجبویه دنایی نام دارد در بسیاری از نقاط جهان دارای خواص دارویی و اجزای فعال است. با وجود آن که یک گیاه بومی وحشی مهم است، اما در حال حاضر، این گیاه در ایران در معرض خطر قرار دارد. علاوه بر این، در مورد اهمیت خواص دارویی و اجزای فعال بادرنجبویه دنایی، در میان مردم ایران اطلاعات کمی وجود دارد. بر این اساس، بررسی سیستماتیک مطالعات مربوط به خواص دارویی و اجزای فعال و اهمیت آن در سلامت انسان و حیوان انجام شد و شکاف های دانش موجود شناسایی شده اند. آیتم های گزارش شده مورد نظر برای بررسی های سیستماتیک و دستورالعمل های متا آنالیز (PRISMA) در جست و جو برای مقالات منتشر شده در مورد خواص دارویی و اجزای فعال زرین گیاه و اهمیت آن برای انسان و حیوان در ایران مورد استفاده قرار گرفتند. این جست و جو محدود به مقالات علمی پایگاه داده های محبوب و موتور های جست و جو مانند PubMed، Web of Science، Google Scholar، Science Direct، SpringerLink و Scopus بود. جست وجو محدود به مجلات علمی، کتاب ها و فصل های کتاب بود که بر خواص دارویی زرین گیاه در ایران در طول سال های 1970 تا 2018 متمرکز بودند. به طور کلی، 1158 مقاله علمی از پایگاه های مختلف استخراج شدند که از این میان 38 مقاله معیارهای جست و جو را برآورده ساختند و برای این بررسی مجاز بودند. این مطالعات فقط در 9 استان از 31 استان ایران انجام شدند و بخش زیادی از آن ها در استان اصفهان، مرکز ایران صورت گرفتند. مطالعات انجام شده نشان دادند که همه بخش های گیاه (ریشه ، بخش های هوایی، گل ها، برگ ها) دارای اجزای فعال هستند. روغن های اساسی و بخش های فعال گیاهان، اجزای اصلی مورد مطالعه بودند. با این وجود، رایج ترین اجزای گزارش شده زانتومیکرول، لیمونن، لووتولین، ژرانیل، آپی ژنین و کالیکوفترین بودند. تعدادی از خواص دارویی گزارش شده میان آن ها عبارت اند از آنتی اکسیدن ها، آنتی باکتری ها، ضد سرطان ها، آنتی هایپرلیپیدمیک، صد اسپاسم و ضد اثرات سیتوتوکسیک. علاوه براین، گزارش شد که این گیاه درمانی برای درد التهابی، سردرد، احتقان، اختلالات کبدی، زخم، تب، درد کلیوی، سوء هاضمه، درد معده، درد شکم، درد مفاصل، اسپاسم عضله، احتقان ، التهاب و اثرات التهاب زخم است. نتیجه گیری: این مطالعه نشان داده است که زرین گیاه یک گیاه دارویی مهم با چند جزء فعال و قابلیت بالا برای حفاظت از سلامت انسان و حیوان در ایران است. با این حال، استفاده بیش از حد از زرین گیاه، وجود آن را در معرض خطر قرار می دهد. با این وجود، مطالعات بیش تری باید در کشور انجام شوند.

نتیجه گیری

این مطالعه نشان داد که بادرنجبویه دنایی دارای اجزای مفیدی است که می توانند برای توسعه دارو مورد استفاده قرار گیرند. در حال حاضر، شواهد حاکی از آن است که گیاهان دارویی دارای خواص داریی با عوارض جانبی همراه هستند. نتیجه این مطالعه نشان دهنده اثر سیتوتوکسی نسبتا قوی عصاره متانول بادرنجبویه دنایی و محتوای بالای فنل ها و فلاونوئیدها در این عصاره ها است. بر اساس این نتایج، بادرنجبویه دنایی می تواند یک گزینه مناسب برای طراحی و تولید دارو های ضد سرطان باشد. با این حال، همانطور که از این بررسی پیدا است، خواص دارویی بادرنجبویه دنایی بر تعدادی از این بیماری ها هر دو در انسان و حیوان مانند اثرات هر دو در انسان و حیوانات مانند ضد ویروسی، ضد قارچی، ضد سمیت، فعالیت عصبی، ایمن سازی و فعالیت های ترویجی به خوبی مورد ارزیابی قرار نگرفته اند. علاوه بر این، تحقیقات مبتنی بر ایمنی سمیت، به ویژه در مقادیر LD50 مناسب از طریق آزمایشات آزمایشگاهی و مطالعات بالینی مورد نیاز می باشند. اگر چه برخی از محصولات گیاهی بادرنجبویه دنایی به طور سنتی توسط افراد محلی در بخش هایی از ایران تهیه شده اند، اما قابلیت آن برای بهره برداری بهتر در سراسر ایران و سراسر جهان مورد استفاده قرار نگرفته است. با توجه به اینکه بادرنجبویه دنایی یک گونه در معرض خطر در ایران است، برای حفاظت از گیاه و بنابراین جلوگیری از حذف احتمالی آن به تلاش بیش تری نیاز است.

Objectives. Dracocephalum has over 60 species and is found mainly in the temperate regions of Asia and Europe. One of these species, i.e., Dracocephalum kotschyi Boiss, is known to have a number of medicinal properties and active ingredients in many parts of the world. Despite being an endemic wild-fowering plant of great importance, the plant is currently considered endangered in Iran. Besides, there is paucity of information on the signifcance of the medicinal properties and active constituents of D. kotschyi among the Iranian people. On that account a systematic review of studies reporting on the medicinal properties and active ingredients and its signifcance to human and animal health was conducted and the existing knowledge gaps were identifed. Methods. Te Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA) guidelines were used in the search for published articles on medicinal properties and active ingredients of D. kotschyi and its signifcance on humans and animals in Iran. Te search was confned to scientifc articles from repositories of popular data bases and search engines among them PubMed, Web of Science, Google Scholar, Science Direct, SpringerLink, and Scopus. Te search narrowed down on scientifc journals, books, and book chapters focusing on the medicinal properties of D. kotschyi in Iran for the period between 1970 and 2018. Results. A total of 1158 scientifc articles were sourced from the various databases, out of which 38 met the search criteria and qualifed for this review. Te studies were conducted in only 9 of the 31 provinces of Iran, with a large proportion in Isfahan province, central Iran. Te studies showed that all plant parts (roots, aerial parts, fowers, and leaves) had active constituents. Essential oils and aerial plant parts were the main components studied. Nevertheless, the most frequently reported constituents were xanthomicrol, limonene, luteolin, geranial, apigenin, and calycopterin. A number of medicinal properties were reported among them antioxidant, antibacterial, anticancerous, antinociceptive, antihyperlipidemic, antispasmodic, cytotoxic, and immunomodulatory efects. Te plant was also reported to be a remedy for infammatory pain, headaches, congestion, liver disorders, ulcer, fever, renal pain, dyspepsia, stomach ache, abdominal pain, joints pains, muscle spasm, congestion, bloating, and wound healing efects, among others. Conclusion. Tis review has shown that D. kotschyi is an important medicinal plant with a large number of active constituents and great potential to safeguard human and animal health in Iran. However, over utilization of the D. kotschyi plant is already endangering its existence. Nevertheless, more studies need be conducted across the country

5- Conclusion

Tis review has noted that D. kotschyi has several benefcial ingredients that can be exploited for drug development. Currently, surmounting evidence suggest that medicinal plants have a number of medicinal properties ofen with minimal side efects. Results of this review further showed a relatively strong cytotoxic efect of methanol extract of D. kotschyi aerial parts and the high content of phenols and favonoids in these extracts. Based on these results, D. kotschyi can be a suitable choice for designing and manufacturing anticancer drugs. However, as is evident from this review, the medicinal properties of D. kotschyi on a number of diseases, both in human and in animals such as antiviral, antifungal, antinephrotoxicity, neuroprotective, immunomodulatory, and growth promoting activities, have not been well evaluated. Additionally, research based on safety and toxicity, especially on the appropriate LD50 values through laboratory tests, and clinical studies are needed. Tough some herbal products of D. kotschyi have been prepared and used traditionally by the locals in parts of Iran, its potential has not been fully exploited for better utilization across Iran and around the worldwide. Given that D. kotschyi is an endangered species in Iran, there is need for concerted efort to conserve and protect the plant and therefore subvert its eventual elimination.

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

ویژگی دارویی و بخش های فعال بادرنجبویه دنایی و اهمیت ان در ایران : یک مطالعه اصولی

Medicinal Properties and Active Constituents of Dracocephalum kotschyi and Its Significance in Iran: A Systematic Review

اخبار و فراتحلیل در مورد آنتی بادی های آنتی بتا 2 آنتی گلیکوپروتئین I و تعیین آنها

News and meta-analysis regarding anti-Beta 2 glycoprotein I antibodies and their determination

خلاصه
1 پیشینه و بالاترین سطح پیشرفت
1.1 از تشخیص آبله تا اتوآنتی بادیهای آنتی-کاردیولیپین
1.2 ارتباط با ترومبوزیز و یا عدم بارداری
1.3 اتوآنتی بادیهای آنتی-بتا دو گلیکوپروتیئن یک (β2-GPI)
1.4 تعیین آنتی بادی آنتی β2-GPI و محدودیت ها
2 بتا2 گلیکوپروتیئن یک: نقش پاتوژنی
2.1 β2-GPI و اپی توپ های پنهان
2.2 اتوآنتی بادیهای آنتی β2-GPI ، یک خانواده ناهمگون
3.2 اتو آنتی بادیهای آنتی β2-GPI و فعال سازی سلولی
4.2 اتوآنتی بادیهای آنتی β2-GPI و APS زایمانی
5.2 اتوآنتی بادیهای آنتی β2-GPI و فعالیت انعقاد طبیعی
2-6 اتوآنتی بادیهای آنتی β2-GPI و تصلب شریان
3 شناسایی آنتی بتا 2 گلیکوپروتیئن 1 و توصیه ها
3-1 اصول فنون
3-2 توصیه های کلی
3-3 β2-GPI حیوانی در برابر β2-GPI انسانی
3-4 حمایت
5.3 میل آنتی بادی به تشکیل پیوند
3-6 ایزوتوپ آنتی بادی
3-7 همراهی با aCLو LA
3-8 شناسایی دومین یک آنتی بتا 2 گلیکوپروتئین I
4 بررسی های عملی
1-4 در نظر گرفتن ایمنوگلوبولین aβ2-GPI و روش های در دسترس برای شناسایی
2-4 در نظر گرفتن ایزوتوپ ایمنوگلوبولین aβ2-GPI
4-3 در نظر گرفتن ایزوتوپ IgA aβ2-GPI
4-4 آنتی بادیهای ضد دومین اول
4-5 آنتی بادیهای آنتی-دومین های 4-5
5 نتیجه گیری
منابع

خلاصه

پیشرفت های کنونی به ما اجازه میدهند که آنتی بادیهایی را پیشنهاد دهیم که بتا-2 گلیکوپروتیئن یک (β2-GPI) را مورد هدف قرار میدهند و اختصاصی ترین آنتی بادیهای مربوط به سندروم آنتی فسفولیپدی (APS) می باشند. بنابراین، امروزه نیاز حیاتی برای ارزیابی های زیستی قدرتمند وجود دارد تا آنها را به طور مناسب مورد بررسی قرار دهد. مشخص شده است که این آنتی بادیها اساسا اپی توپ های پنهان را تشخیص میدهند و در انتخاب تست های آزمایشگاهی مربوط به شناسایی این آنتی بادیها نیاز به دقت زیاد می باشد. برای رسیدن به این هدف، مطالعه متاآنالیز بر روی نقش پاتوفیزیولوژیک β2-GPI انجام شد تا یک دید کلی نسبت به پیشرفت های کنونی که برای شناسایی آنتی β2-GPI صورت گرفت است فراهم کند.

1 پیشینه و بالاترین سطح پیشرفت 

1.1 از تشخیص آبله تا اتوآنتی بادیهای آنتی-کاردیولیپین

در حالیکه تعریف سندروم آنتی فسفولیپید (APS) در سال 1999 ارائه شد (1)، تاریخ زیست شناسی آنتی بادیهای آنتی فسفولیپیدی (APLA) به خیلی قبل تر و در اولین دهه قرن بیستم و در زمان توسعه ارزیابی های مربوط به تشخیص آبله بر  میگردد. در واقع، قبل از بوردت و جینگو، وسمن اولین فردی بود که در سال 1906 واکنش فیکساسیون کمپلمان را  برای تست جدید در جهت تشخیص آبله با استفاده از عصاره کبدی جنین مرده مبتلا به آبله ارثی به عنوان منبع آنتی ژن به کار برد  (2). این منبع آنتی ژنی خیلی زود بوسیله لندستینر با عصاره الکلی حاصل از قلب گاو مبتلا به آبله جایگزین شد. لندستینر کسی بود که بعدها آزمایش آزمایشگاه تجسس بیماری‌های آمیزشی (VDRL) را طرح ریزی کرد. سپس در سال 1941 پانگبورن فسفولیپیدهای میتوکندریایی را به عنوان منبع اصلی آنتی ژن حاصل از عصاره گاوی توصیف کرد که به دلیل اینکه از قلب منشا می گرفت کاردیولیپین نامیده شد (3). این بهبود در روند آزمایش منجر به توسعه آزمایش های دقیق تر آبله با استفاده از کاریدولیپین خالص سازی شده گردید (4). سپس مشخص شد که در واقع کاردیولیپین یک فسفاتیدل گلیسرول است اگرچه ما همچنان نام کاردیولیپین را به کار میگیرم.

5 نتیجه گیری

به طور کلی در طی 30 سال اخیر پیشرفت هایی در مورد تشخیص زیستی APS و کشف نقش مرکزی aβ2-GPI در APS وجود داشته است. این مورد منجر به قرار گرفتن اتوانتی بادیهای aβ2-GPI G/M به عنوان معیار تشخیص APS در سال 2006 شده است اما این امیدواریها کامل نبوده و بهبودهایی از آن زمان صورت گرفته است.

Abstract

Recent advances allow us to propose antibodies targeting beta-2-glycoprotein I (β2-GPI) as the most specific antibodies associated with anti-phospholipid syndrome (APS). Therefore, there is now a crucial need for powerful biological assays to adequately monitor them. It is well established that these antibodies recognize mainly cryptic epitopes, which requires a great deal of consideration in the choice of laboratory tests to identify these antibodies. To this end, an update on the pathophysiological role of β2-GPI and a meta-analysis were conducted providing an overview of the current progress towards anti-β2-GPI detection.

1 History and STATE of the art

1.1 From syphilis diagnosis to the anti-cardiolipin autoantibodies

While the definition of the antiphospholipid syndrome (APS) was established in 1999 [1], the biological history of the antiphospholipid antibodies (APLA) started long before that in the first decade of the 20th century with development of assays for the diagnosis of syphilis. Indeed, Wassermann was the first in 1906 to apply the complement fixation reaction, previously described by Bordet and Gengou, in a new test for the diagnosis of syphilis using fetal liver extracts from dead embryos with congenital syphilis as an antigenic source [2]. This antigenic source was shortly replaced with an alcoholic extract from nonsyphilis beef heart by Landsteiner who had then developed the Venereal Disease Research Laboratory Test (VDRL). Later on in 1941, Pangborn characterized mitochondrial phospholipids, called cardiolipin because of its cardiac origin, as the main antigenic source from the beef extract [3]. This improvement led to the development of more accurate syphilis tests using purified cardiolipin [4]. It was then shown that cardiolipin was in fact phosphatidylglycerol, though we kept the cardiolipin appellation.

5 Conclusion

In conclusion, several advancements were made in the biological diagnosis of APS over the last thirty years and the discovery of the central role played by aβ2-GPI in APS. This has led to the inclusion of aβ2-GPI G/M autoantibodies in the APS diagnostic criteria of 2006 with high hopes, but those hopes have been incompletely satisfied while some improvements were made since that time.

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

اخبار و فراتحلیل در مورد آنتی بادی های آنتی بتا 2 آنتی گلیکوپروتئین I و تعیین آنها

News and meta-analysis regarding anti-Beta 2 glycoprotein I antibodies and their determination

محلول های دیواره سلولی ریشه گیاهان زراعی در خاک های شور

Root cell wall solutions for crop plants in saline soils

چکیده

1- مقدمه

2- توانایی ترکیب Na+ به اجزاء دیواره سلولی

3- تغییر در ترکیب شیمیایی دیواره های سلولی ریشه در پاسخ به تیمار نمک

4- تغییرات کارکرد دیواره سلولی در اثر شوری

5- موانع انتشار ریشه و تغییرات شوری

6- فعل و انفعالات نمک با پروتئین های دیواره سلولی

7- چشم انداز آتی

چکیده

رشد ریشه اغلب گیاهان زراعی در اثر شوری خاک مهار می شود. ریشه با تعدیل متابولیسم، بیان ژنی و فعالیت پروتئین که منجر به تغییر در ترکیب دیواره سلولی، فرآیندهای نقل و انتقال، اندازه و شکل سلول، و معماری ریشه می گردد، به آن پاسخ می دهد. در اینجا، ما درباره اثرات تنش شوری بر دیواره سلولی که منجر به تغییر آنزیم، گرایش میکروفیبریل سلولز و رسوب پلی ساکارید غیرسلولزی در نواحی افزایش طول ریشه به عنوان عوامل مهم بازدارندگی افزایش طول ریشه می گردد تمرکز نموده و بر تغییرات دیواره سلولی مرتبط با تحمل تنش شوری و محدودیت آب ریشه ها تاکید نمودیم. تنش شوری باعث القاء تغییراتی در ترکیب دیواره انواع مختلف سلول های خاص ریشه از جمله افزایش رسوب لیگنین و سوبرین در سلول های اندودرمی و اگزودرمی می گردد. این تغییرات با جلوگیری از اتلاف آب و تغییر مسیر نقل و انتقال یون در جهت منفعت گیاه عمل می نمایند. ما نشان دادیم که ترکیب یون های Na+ با اجزای دیواره سلولی می تواند بر عبور Na+ تاثیر گذاشته و Na+ قادر است بر ترکیب یون های دیگر اثر گذاشته و مانع کارکرد پکتین در خلال رشد سلولی گردد. وقوع تفاوت های طبیعی در ساختار دیواره سلولی، منابع جدیدی را برای اصلاح محصولات زراعی فراهم می نماید که دارای تحمل پذیری بیشتری نسبت به شوری می گردند.

7- چشم انداز آتی

برای درک ارتباط بین تغییرات رونویسی در ژن های دیواره سلولی و سازگاری با شوری ما باید به شناسایی و یا ایجاد تنوع ژنتیکی در ژن های تنظیم کننده ویژگی های دیواره سلولی و توصیف نحوه تاثیرگذاری تغییرات بر خواص شیمیایی دیواره سلولی تحت شرایط شوری بپردازیم. اندازه گیری تنوع در خواص شیمیایی دیواره سلولی باید تفاوت های مکانی و زمانی را لحاظ نموده و از استراتژی هایی مانند استراتژی مورد استفاده برای مطالعات پروتئومی و متابولومیک رشد ریشه در خاک شور پیروی نمود که در آن نوک ریشه به سه منطقه تقسیم می گردد که معرف مناطق فعال تقسیم، طویل شدن و تمایز سلولی است [19،20]. مبانی ژنتیکی پاسخ رشد فوق الذکر به تنش شوری در غلاتی مانند برنج، با ترکیبات فنوتیپی مبتنی بر تصویر همراه با روش های ارتباط ژنومی مورد آزمایش قرار گرفته است [115]. قدم بعدی کاوش با روش های مزبور درباره تنوع فنوتیپی در پاسخ ریشه غلات تحت تنش شوری و یافتن جایگاه ژنتیکی تنظیم صفات مربوط به سازگاری با تنش شوری است. تا به امروز تحمل به شوری در غلات با صفاتی ارتباط داشته که گیاه را قادر به تغییر سریع رشد ریشه خود در پاسخ به شور و صفاتی که محدود کردن نقل و انتقال Na+ ریشه به ساقه را مانند جداسازی بهتر Na+ در بافت های ریشه محدود نماید. برای تکمیل این اطلاعات ما باید نحوه تاثیرگذاری تفاوت های هر جزء آپوپلاسمی سلول های ریشه بر برهمکنش دیواره سلولی با یون ها و عبور یون ها را تعیین نماییم.

Abstract

The root growth of most crop plants is inhibited by soil salinity. Roots respond by modulating metabolism, gene expression and protein activity, which results in changes in cell wall composition, transport processes, cell size and shape, and root architecture. Here, we focus on the effects of salt stress on cell wall modifying enzymes, cellulose microfibril orientation and non-cellulosic polysaccharide deposition in root elongation zones, as important determinants of inhibition of root elongation, and highlight cell wall changes linked to tolerance to salt stressed and water limited roots. Salt stress induces changes in the wall composition of specific root cell types, including the increased deposition of lignin and suberin in endodermal and exodermal cells. These changes can benefit the plant by preventing water loss and altering ion transport pathways. We suggest that binding of Na+ ions to cell wall components might influence the passage of Na+ and that Na+ can influence the binding of other ions and hinder the function of pectin during cell growth. Naturally occurring differences in cell wall structure may provide new resources for breeding crops that are more salt tolerant.

7- Future prospects

To understand the links between the transcriptional changes in cell wall genes and adaptations to salinity we need to identify or create genetic variation in the genes regulating cell wall properties and characterise how the variation influences cell wall chemistry in saline conditions. The measurement of variation in cell wall properties must capture spatial and temporal differences, following strategies such as those used for proteomic and metabolomics studies of root growth in saline soil where the root tip is divided into three regions representing active cell division, elongation and differentiation zones [19,20]. The genetic basis of the above ground growth response to salt stress in cereals, such as rice, has been tested by combining image-based phenotyping with genome-wide association methods [115]. The next step is to go underground with these methods, to phenotype diversity in cereal root salt stress responses and find the genetic loci regulating traits linked to salt stress adaptation. To date tolerance to salinity in cereals has been linked to traits that enable plants to rapidly alter their root growth in response to salt and traits that limit root-to-shoot transport of Na+, such as better sequestration of Na+ in root tissues. To complement this information we need to determine how differences in each apoplasmic component in root cells influences cell wall interactions with ions and the passage of ions.

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

محلول های دیواره سلولی ریشه گیاهان زراعی در خاک های شور

Root cell wall solutions for crop plants in saline soils

مطالعه تنوع ژنتیکی با استفاده از نشانگرهای ژنتیکی مولکولی

Genetic diversity studies using molecular genetic markers

خلاصه

مقدمه

DNA میتوکندریایی برای مطالعه ی تنوع در دام

SNP (پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی): یکی از مهم ترین مارکرهای DNA هسته ای

مارکرهای SNP ایجاد شده از طریق روش توالی یابی سنگر

توسعه و به کارگیری توالی یابی نسل جدید (NGS) با استفاده از داده های SNP با چگالی بالا

مارکرهای SNP درمقایسه با مارکرهای MS

چکیده

خصوصیات فنوتیپی دام از طریق تغییرات ژنتیکی همراه با تغییرات محیطی حیوانات تعیین می شود. در گذشته، طبقه بندی نژاد به خصوصیات مورفولوژیکی برای شناسایی نژاد بستگی داشت. اما در سال های اخیر، مارکرهای ژنتیکی زیادی برای شناسایی نژادهای مختلف و افراد حیوانات بررسی شده است. این مارکرهای ژنتیک مولکولی می توانند برای ارزیابی تنوع ژنتیکی و نیز شناسایی و ردیابی گونه ها استفاده شوند. اخیرا، یک روش توالی یابی دقیق و سریع، وجود انواعی از مارکرهای ژنتیکی را در کل ژنوم تایید کرده است. بنابراین، مارکرهای پیشرفته ی SNP و فناوری در حال گسترش SNP array به سرعت در حال جایگزین شدن به جای آنالیز تنوع ژنتیکی با مارکرهای ریزماهواره هستند.  بنابراین، این مقاله ی مروری به بررسی اطلاعات اساسی در توسعه ی مارکرهای ژنتیک مولکولی و استفاده از آنها برای مطالعات تنوع ژنتیکی در دام ها می پردازد. 

مقدمه 

به طور کلی، بسیاری از نژادهای دامی موجود چندین قرن انتخاب طبیعی و مصنوعی را پشت سر گذاشته اند. بنابراین، نژادهای مختلف به شرایط محیطی  و معیارهای تولیدی متفاوت سازگار شده اند. در نتیجه، دام ها دارای خصوصیات فنوتیپی متفاوتی هستند که آنها را از سایر زیر گروه های موجود در یک گونه متمایز می کند؛ با این وجود، در تمایز این افراد یا گروه از دام ها با استفاده از مورفولوژی و نمونه های زیستی مانند، خون، بافت و ترشحات مشکلات و محدودیت هایی وجود دارد. این مشکل با استفاده از طبقه بندی ژنتیکی فنوتیپ های مخنلف از طریق یافتن پروفایل DNA و تنوع ژنتیکی حل شده است (سیوان، 2001). بویژه در DNA میتوکندریایی و DNA  هسته ای . در حقیقت این الگوی تنوع ژنتیکی اشکال مختلفی دارد مانند چندشکلی تک نوکلئوتیدی (SNP)، دخول و حذف (indel)، تکرارهای ساده پشت سرهم (STR)، و تنوع در کپی نامبر (CNV). 

مارکرهای SNP درمقایسه با مارکرهای MS 

علی رغم این حقیقت که مارکرهای MS  بسیار پلی مورفیک هستند، اما تکنیک MS تایپینگ کم کم در حال محدود شدن است. خصوصا به دلیل محدودیت تکنیکی، نیروی کار زیاد و هزینه ی بالا. یکی از مشکلات تکنیکی مارکرهای MS ناپیوستگی اندازه ی آلل هاست که اختلاف نتایج آزمایشگاه های مختلف را تشدید می کند. دلیل تفاوت اندازه ی آلل ها این است که اندازه ی آلل ها بسته به شرایط واکنش PCR به صورت متفاوتی اندازه گیری می شوند. برای مثال پلی مراز Taq بسته به شرایط PCR تعداد متفاوتی از آدنین ها را در انتهای 3’ ایجاد می-کند. این توالی های نوکلئوتیدی اضافی منجر به تولید محصولات PCR با اندازه های نادرست می شود.

Abstract

The phenotype traits of livestock are determined by the genetic variation with environmental variation of individual animals. In the past, the classification of breed was depending on morphological characteristics to identify breed. However, in recent years, various genetic markers can be analyzed to identify different breeds and individual animals. These molecular genetic markers can be used to assess the genetic diversity as well as tracking the species origin and identification. Recently, a genome sequencing technology can be rapidly and accurately confirmed the various type of genetic markers in the entire genome area. Of these, developed SNP markers and the rapidly evolving SNP array technology are increasingly replacing genetic diversity analysis using microsatellite markers. Therefore, this review discussed the basic information for developing various molecular genetic markers and their use in genetic diversity studies of livestock animals.

Introduction

In general, many livestock breed present today have pass through the centuries of natural and human selection. Thus, different breeds were adopted to different environment condition and production criteria. As the results, livestock animals have different phenotypic characteristics that distinguish them from other subgroups in the same species; however, there are difficulties and limitations in distinguishing between different individuals and groups using their basic morphology or biological samples such as blood, tissue, and secretions. This problem has resolved by the genetic classification of individuals of different phenotypes by discovering their DNA profile and genomic level variation (Syvanen, 2001). Particularly, in mitochondrial DNA (mtDNA) and nuclear DNA. In fact, these patterns of genetic variation have various forms such as single nucleotide polymorphism (SNP), insertion and deletion (indel), simple tandem repeat (STR), copy number variation (CNV).

SNP markers versus MS markers

Despite the fact that the MS markers are high polymorphic, the MS typing technique is becoming limited use. Especially, because of the technical limit, the labor intensive and the cost of the experiment. One of the technical problems with MS markers is the inconsistency of allele sizes, which makes it difficult to contrast the results generated from various laboratories (Vignal et al., 2002). The reason for the different size of alleles is that allele sizes are measured differently depending on the condition of PCR reaction. For an example; Taq polymerase has synthesized different adenine number at the 3’ end of the PCR fragment, depending on the PCR amplification conditions (Brownstein et al., 1996). These additional nucleotide sequences lead to incorrect PCR amplification sizes (Ginot et al., 1996).

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

مطالعه تنوع ژنتیکی با استفاده از نشانگرهای ژنتیکی مولکولی

Genetic diversity studies using molecular genetic markers

کیت ابزار CRISPR جهت ویرایش ژنوم و فراتر از آن

The CRISPR tool kit for genome editing and beyond

• برای دانلود رایگان مقاله انگلیسی با فرمت pdf بر روی عنوان انگلیسی مقاله کلیک نمایید.
• برای خرید و دانلود ترجمه فارسی آماده با فرمت ورد، روی عنوان فارسی مقاله کلیک کنید.

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

کیت ابزار CRISPR جهت ویرایش ژنوم و فراتر از آن

The CRISPR tool kit for genome editing and beyond

• برای دانلود رایگان مقاله انگلیسی با فرمت pdf بر روی عنوان انگلیسی مقاله کلیک نمایید.
• برای خرید و دانلود ترجمه فارسی آماده با فرمت ورد، روی عنوان فارسی مقاله کلیک کنید.

پیشرفت های جدید در زیست حسگرهای الکتروشیمیایی مبتنی بر نانولوله کربنی

Recent advances in carbon nanotube based electrochemical biosensors

• برای دانلود رایگان مقاله انگلیسی با فرمت pdf بر روی عنوان انگلیسی مقاله کلیک نمایید.
• برای خرید و دانلود ترجمه فارسی آماده با فرمت ورد، روی عنوان فارسی مقاله کلیک کنید.

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

پیشرفت های جدید در زیست حسگرهای الکتروشیمیایی مبتنی بر نانولوله کربنی

Recent advances in carbon nanotube based electrochemical biosensors

• برای دانلود رایگان مقاله انگلیسی با فرمت pdf بر روی عنوان انگلیسی مقاله کلیک نمایید.
• برای خرید و دانلود ترجمه فارسی آماده با فرمت ورد، روی عنوان فارسی مقاله کلیک کنید.

تأثیر تغذیه و اپی ژنتیک محیطی بر سلامت و بیماری انسان

The Impact of Nutrition and Environmental Epigenetics on Human Health and Disease

چکیده

1. مقدمه

1.1 یک مقدمه کوتاه در مورد اپی¬ژنتیک

1.2 اپی¬ژنتیک محیطی

1.3 سرطان: وضعیت فعلی و چشم انداز آینده

1.4 بررسی اجمالی مقاله

2. اپی¬ژنتیک تغذیه¬ای

2.1 اپی¬ژنتیک تغذیه¬ای در سلامت و بیماری

2.2 اپی¬ژنتیک تغذیه¬ای و سرطان

2.3 اپی¬ژنتیک تغذیه¬ای: آینده

3. اپی¬ژنتیک شیمیایی محیطی

3.1 مواد شیمیایی مختل¬کننده¬ی سیستم درون¬ریز ( EDCs)

3.1.1 قرار گرفتن در معرض EDC موجب نمو، رفتار و بیماری غیرطبیعی می¬شود

3.1.2 EDCs، اپی¬ژنتیک و سرطان

3.2 سایر مواجهات سمی و اثرات اپی¬ژنتیک

4. اپی¬ژنتیک محیطی و سرطان: سرطان پستان به عنوان یک مثال خاص

5. پتانسیل داروهای اپی¬ژنتیکی

6. نتیجه¬گیری

7. پیام¬های اصلی

منابع

چکیده

 اپی ژنتیک محیطی، چگونگی تأثیر عوامل محیطی بر اپی ژنتیک سلولی و در نتیجه سلامت انسان را توصیف می کند. علائم اپی ژنتیکی ساختار فضایی کروماتین را برای تنظیم بیان ژن تغییر می دهد. عوامل محیطی با اثرات اپی ژنتیکی شامل رفتار، تغذیه و مواد شیمیایی و آلاینده های صنعتی هستند. مکانیسم های اپی ژنتیک همچنین در طول نمو در داخل رحم و در سطح سلولی دخالت دارند، بنابراین اثرات زیست محیطی ممکن است از طریق آسیب زدن به اپی-ژنوم موجود زنده در حال رشد برای اصلاح خطر بیماری در آینده، به جنین آسیب برساند. در مقابل، اجزای غذایی زیست فعال ممکن است باعث ایجاد تغییرات اپی ژنتیکی حافظتی در طول زندگی شوند و تغذیه در ابتدای زندگی از اهمیت ویژه ای برخوردار است. فراتر از ژنتیک، وضعیت کلی سلامت فرد را می توان به عنوان یکپارچگی بسیاری از سیگنال های محیطی که از زمان بارداری آغاز شده و طی تغییرات اپی ژنتیکی عمل می کنند، در نظر گرفت. این مقاله به بررسی چگونگی تأثیر محیطی اپی ژنوم بر سلامت و بیماری، با توجه ویژه به سرطان می پردازد. درک اثرات مولکولی رفتار، مواد مغذی و آلاینده ها ممکن است مربوط به ایجاد استراتژی های پیشگیرانه و برنامه های بهداشت شخصی باشد. علاوه بر این، داروهای اپی ژنتیک می توانند با بازیابی تمایز سلولی، یک استراتژی بالقوه برای درمان بسیاری از بیماری ها از جمله سرطان باشند.

1. مقدمه

1.1 یک مقدمه کوتاه در مورد اپی ژنتیک

اپی ژنتیک به کنترل بیان ژن به وسیله مکانیسم هایی که به طور مستقیم به توالی کدکننده ی DNA مربوط نیستند، اشاره دارد [1]. در نتیجه، تمام سلول های موجود در یک ارگانیسم با وجود ژنوم مشابه، دارای فنوتیپ های بسیار متفاوت هستند. اپی ژنتیک باعث مدولاسیون و تنظیم بیان ژن از طریق “علائم” مختلف اپی ژنومی می شود و این اصطلاح مربوط به ترکیبات شیمیایی اضافه شده به DNA یا پروتئین های هیستون است که توسط آنزیم هایی شناسایی می شود که علامت خاصی را تنظیم کرده یا حذف می کنند. این علائم ساختار فضایی کروماتین را تغییر می دهند: آن را فشرده کرده و باعث جلوگیری از اتصال فاکتورهای رونویسی به DNA شده و یا اینکه آن را باز می-کنند و باعث اتصال فاکتور رونویسی و معمولا افزایش تنظیم فرآیندهای سلولی می شوند.

7. پیام های اصلی

• تغذیه (به ویژه رژیم غذایی و الگوهای تغذیه ای مادر) و آلاینده های شیمیایی، دو عامل مهم محيطی هستند که بر سلامت انسان تاثیر می گذارند.

• این عوامل با مشارکت در پاتوژنز بسیاری از بیماری ها، به ویژه سرطان، تاثیر مستقیمی روی فرد دارند.

• علاوه بر این، این عوامل احتمالا از طریق انتقال اپی ژنتیکی به نسل های بعدی منتقل می شوند و به عنوان یکی از مهمترین مشکلات جهانی بهداشت عمومی، برای فرد و همچنین نسل های آینده و جامعه است.

• شناخت مکانیزم های مولکولی و مسیرهای سیگنال دهی درگیر در اپی ژنتیک محیطی راه را برای بهداشت عمومی و مداخلات هدفمند برای کاهش اثرات اجتماعی آنها باز می کند.

Abstract

Environmental epigenetics describes how environmental factors affect cellular epigenetics and, hence, human health. Epigenetic marks alter the spatial conformation of chromatin to regulate gene expression. Environmental factors with epigenetic effects include behaviors, nutrition, and chemicals and industrial pollutants. Epigenetic mechanisms are also implicated during development in utero and at the cellular level, so environmental exposures may harm the fetus by impairing the epigenome of the developing organism to modify disease risk later in life. By contrast, bioactive food components may trigger protective epigenetic modifications throughout life, with early life nutrition being particularly important. Beyond their genetics, the overall health status of an individual may be regarded as an integration of many environmental signals starting at gestation and acting through epigenetic modifications. This review explores how the environment affects the epigenome in health and disease, with a particular focus on cancer. Understanding the molecular effects of behavior, nutrients, and pollutants might be relevant for developing preventative strategies and personalized heath programs. Furthermore, by restoring cellular differentiation, epigenetic drugs could represent a potential strategy for the treatment of many diseases including cancer.

1. Introduction

1.1. A Brief Introduction to Epigenetics

Epigenetics refers to the control of gene expression via mechanisms not directly related to the DNA coding sequence [1]. As a result, all cells in an organism have very different phenotypes despite having the same genome. Epigenetics modulates and regulates gene expression through various epigenomic “marks”, the term given to chemical compounds added to DNA or histone proteins and recognized by enzymes that either lay down or remove the specific mark. These marks change the spatial conformation of chromatin: either compacting it, thereby preventing the binding of transcription factors to the DNA, or opening it, allowing transcription factor binding and usually upregulating cellular processes.

7. Take-Home Messages

• Nutrition—in particular maternal diet and dietary patterns—and chemical pollutants are two important environmental factors that impact human health.

• These factors have a direct impact on the individual by contributing to the pathogenesis of many diseases, not least cancer.

• Furthermore, these factors probably span generations through epigenetic transmission, making them a major global public health problem not only for the individual but also future generations and society.

• Understanding the molecular mechanisms and signaling pathways involved in environmental epigenetics paves the way for both public health and targeted interventions to reduce their societal impact.

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

تأثیر تغذیه و اپی ژنتیک محیطی بر سلامت و بیماری انسان

The Impact of Nutrition and Environmental Epigenetics on Human Health and Disease

جنبه های فیزیولوژیکی و ژنتیکی پروسه رویان زایی سوماتیکی در گونه های مخروطی

Plant physiological and genetical aspects of the somatic embryogenesis process in conifers

چکیده

فرایندهای عملی برای جنین زایی سوماتیکی در سوزنی برگ ها

کاربرد SE: امکانات و محدودیت ها در طول فرآیند in vitro

آغاز کشت SE

تکثیر جنین های سوماتیکی مراحل اولیه

بلوغ و جوانه زنی جنین های سوماتیکی

انتخاب ژنتیکی غیرعمدی

پایداری ژنتیکی در طول فرآیند SE

انطباق گیاه SE پس از فرآیند SE in vitro

عملکرد مزرعه ای گیاهان SE

تولید تجاری و استفاده از گیاهان مخروطی SE

فعال سازی تولید گیاه SE از طریق اتوماسیون

تولید گیاه SE توسط تکنولوژی مبتنی بر سیال: سیستم سیالی SE

سیستم سیالی SE: آغاز کشت SE

سیستم سیالی SE: تکثیر، بلوغ و برداشت

سیستم سیالی SE: پلت فرم جوانه زنی و کاشت

اظهارنظرهای مربوط به شرایط سوئد و سناریوهای احتمالی

اولویت های تحقیق

چکیده

فرآیندهای تولید استوک کشت سوزنی برگ ها توسط جنین زایی سوماتیکی (SE) در سوزنی برگ ها شرح داده شده است. پیاده سازی SE فرصت ها و محدودیت هایی را در مراحل مختلف فرآیند in vitro ارائه می کند. موضوع ثبات ژنتیکی یا تنوع somaclonal، نگران کننده بوده و مورد بررسی قرار گرفته است. در فرآیندهای in vitro، عوامل متعددی بر انطباق پذیری موفقیت آمیز، رشد زودرس و عملکرد مزرعه ای استوک کشت SE تأثیر می گذارند. تجربه های موجود در مورد سایر گونه های سوزنی برگ در زمینه تولید تجاری بررسی شده است. در حالی که تولید SE از گذشته ها به عنوان یک فرایند بسیار کارآمد بوده است، پیشرفت های اخیر به منظور خودکار سازی مراحل مختلف صورت گرفته است. پیشرفت هایی برای فعال کردن SE برای صنوبر نروژی در سوئد شرح داده شده است.

اولویت های تحقیق

روش آزمایشگاهی پایه برای تکثیر یک جنین بذر زیگوتی برای تولید بسیاری از گیاهان توسط SE در دهه 1980 ایجاد شد. امروزه تولید گیاه از طریق SE برای بسیاری از گونه های مخروطی موفقیت آمیز بوده است ((Salaj et al. 2015; Klimaszewska et al. 2016). روش های جدید بهبود یافته و اخیرا اتوماسیون برای تولید مقادیر مقرون به صرفه در مقیاس بزرگ، در حال حاضر تولید گیاه SE را به عنوان یک ابزار برای عملیات جنگلداری برای دستیابی به مزایای ژنتیکی از برنامه های اصلاح گیاه امکان پذیر ساخته است. علاوه بر این، نشان داده شده است که SE می تواند از ریزنمونه های ساقه اولیه ده ساله از یک ژنوتیپ از گیاهان مشتق شده از SE از صنوبر سفید آغاز شود (Kli maszewska et al. 2011) که نشان دهنده ی امکان توسعه روش های موثر برای شروع SE از بافت های بالغ مخروطی در بین گونه ها و ژنوتیپ ها است.

Abstract

The processes for producing conifer planting stock by somatic embryogenesis (SE) in conifers are described. Implementation of SE presents opportunities and limitations at various stages of the in vitro process. The topic of genetic stability, or somaclonal variation, is a particular concern and reviewed. Following the in vitro processes, several factors affect the successful acclimation, early growth and field performance of SE planting stock. Experiences with other conifer species in the context of commercial production are reviewed. While SE production has historically been a very labor-intensive process, recent advances have been made to automate the various steps. Developments to enable SE for Norway spruce in Sweden are described.

Research priorities

The fundamental laboratory method for multiplying a zygotic seed embryo to generate many plants by SE was established in the 1980s. Today, plant generation by SE has been successfully demonstrated for many conifer species (Salaj et al. 2015; Klimaszewska et al. 2016). New improved methods, and recently automation for enabling cost-effective large-scale production, have now made SE plant production feasible as a tool for operational forestry to capture genetic gains from breeding programs. Furthermore, it has been shown that SE can be initiated from ten year old primordial shoot explants from one genotype of SE-derived plants of white spruce (Klimaszewska et al. 2011) suggesting possibilities to develop effective methods for initiation of SE from mature conifer tissue across species and genotypes.

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

جنبه های فیزیولوژیکی و ژنتیکی پروسه رویان زایی سوماتیکی در گونه های مخروطی

Plant physiological and genetical aspects of the somatic embryogenesis process in conifers

تنظیم کننده های کلیدی بیماری های قلبی عروقی با RNA های غیر کد کننده طولانی

Long Non-Coding RNAs as Key Regulators of Cardiovascular Diseases

چکیده

استراتژی هایی برای شناسایی lncRNA های عملکردی

lncRNA های عملکردی در تکوین قلب

LncRNA های عملکردی در هایپرتروفی قلبی

lncRNA عملکردی در نارسایی قلبی

lncRNA های عملکردی در آترو اسکلروز

مسیرهای آینده در مطالعات پیرامون lncRNA ها

نتیجه گیری

منابع

ژن های کدکننده ی پروتئین کمتر از 1 درصد از کل ژنوم را تشکیل می دهند. با این حال، پیشرفت های صورت گرفته در توالی یابی RNA و آنالیز گسترده ی ژنوم نشان داده است که بیشترین بخش ژنوم قادر به رونویسی است. علاوه بر این، مطالعات اخیر نشان داده اند RNA های غیر کدکننده ی طویل (lncRNAs)، تنظیم‌کننده‌های حیاتی بیان ژن و اپی ژنتیک در شرایط فیزیولوژیک و بیماری هستند. چندین lncRNAs از نظر عملکردی در بیماری های قلبی عروقی درگیر هستند و ممکن است اهداف درمانی بالقوه باشند. در اینجا، ما با تمرکز بر روی تکوین قلب، هایپرتروفی، نارسایی قلبی و آترواسکلروز، استراتژی های فعلی را برای کشف lncRNA های عملکردی و lncRNA هایی که اخیرا در حوزه ی قلب و عروق کشف شده اند؛ بررسی می کنیم. ما همچنین در مورد پتانسیل های درمانی RNA های سنتزی برای تنظیم این lncRNA ها و مسیرهای آینده در این زمینه ی تحقیقاتی بحث می کنیم.

مسیرهای آینده

در مطالعات پیرامون lncRNA ها نشان داده شده است که lncRNA ها تنظیم کننده های مهم در شرایط فیزیولوژیک و پاتولوژیک هستند. مطالعات اخیر شواهد قابل ملاحظه ای را از اثرات lncRNA ها بر روی مراحل مختلف بیماری های قلبی عروقی ارائه داده اند. از آنجا که هر lncRNA عملکرد متمایزی دارد؛ انجام تحقیقات بیشتر برای درک پیچیدگی بیولوژی lncRNA ضروری است. در مورد برخی از lncRNA ها، مهار یا فعال سازی آنها منجر به اثرات مفید بر روی شرایط بیماری می شود؛ بنابراین، توسعه ی تکنیک هایی که تنظیم فضایی زمانی lncRNA ها را امکانپذیر می سازند ممکن است نویدبخش برنامه های بالینی درمانی باشد.

Protein-coding genes account for less than 2% of the whole genome. However, the advances in RNA sequencing and genome-wide analysis have demonstrated that most of the genome is capable of being transcribed. Moreover, recent studies have suggested that long non-coding RNAs (lncRNAs) are critical regulators of gene expression and epigenesis in both physiological and disease states. Several lncRNAs are functionally involved in cardiovascular diseases and may be potential therapeutic targets. Here, we review the current strategies for the discovery of functional lncRNAs and recently discovered lncRNAs in the cardiovascular field, focusing on cardiac development, hypertrophy, heart failure, and atherosclerosis. We also discuss the therapeutic potentials of synthetic RNAs to modulate these lncRNAs and future directions in this research field.

Future Directions of lncRNAs Studies

The lncRNAs have been shown to be important regulators in physiological and pathological states. Recent studies provide considerable evidence of the effect of lncRNAs on various stages of cardiovascular diseases. Because each lncRNA has a distinct mode of action, further investigations are required to understand the complexity of lncRNA biology. In the case of some lncRNAs, inhibition or activation leads to beneficial effects on a disease condition; therefore, the development of techniques that enable the spatiotemporal regulation of lncRNAs may hold the promise of clinical therapeutic applications.

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

تنظیم کننده های کلیدی بیماری های قلبی عروقی با RNA های غیر کد کننده طولانی

Long Non-Coding RNAs as Key Regulators of Cardiovascular Diseases

نشانگرهای زیستی پروتئومیکس در نارسایی قلبی

Proteomic Biomarkers of Heart Failure

نکات کلیدی

مقدمه

کشف بیومارکرهای پروتئومی

مارکرهای فشار قلبی

پپتید نوع B ناتریورتیک / پپتد ناتریورتیک نوع B پرو N ترمینال

اشکال مولکولی پپتید ناتریورتیک نوع B

پپتید ناتریورتیک دهلیزی

ST2

پروآدرنومدولین میانجیگر

مارکرهای التهاب یا آسیب دیدگی

تروپونین

پروتئین اتصال به اسید چرب نوع قلبی

پروتئین واکنشی C

اینترلوکین 6

مارکرهای فعالیت عصبی هورمونی

کوپپتین

ماتریکس متالوپروتئیناز

مارکرهای بازسازی مجدد

گالکتین – 3

فاکتور تمایز رشد – 15

مارکرهای بیماری های همراه مرتبط

سیستاتین C

لیپوکالین مرتبط با – نوتروفیل ژلاتیناز

پروکلسی تونین

بیومارکرهای پروتئومی همزمان

خلاصه

منابع

مقدمه

تخمین زده شده است که بیشتر از 20000 ژن کد کننده ی پروتئین، مسئول حضور بیشتر از 1 میلیون پروتئین دیده شده در ماتریس های زیستی هستند. 1 اندازه گیری این پروتئین ها، معمولا در نمونه های پلاسما، سرم، ادرار، بزاق و بافت ، پیشرفت های مهمی را در علوم پزشکی از طریق توسعه ی آزمایش های تشخیصی و پیش گویانه برای بیماران دارای و یا در معرض خطر یک گروهی از بیماری ها فراهم کرده است. 3 استفاده از سنجش های پروتئینی به ویژه برای ارزیابی بیماری قلبی عروقی سودمند است، به طوری که به ترتیب، شمول قابل توجهی از پپتیدهای ناتریورتیک و ایزوفرم های تروپونین در تصمیم گیری بالینی برای نارسایی قلبی (HF)4 و سندرم های کرونر حاد (ACS)5، وجود دارد. سنجش های بالینی مواد بیولوژیک درون زاد، مانند پروتئین ها، لیپیدها، و متابولیت ها معمولا تحت عنوان بیومارکرها اشاره می شوند و اطلاعات پاتوفیزیولوژیکی را از طریق یک برهم کنش انجمنی یا مکانیکی مستقیم با سیستم، اندام یا بافت بیمار فراهم می کنند. 6 روابط بیومارکرهای پروتئین با بیماری به پزشکان اجازه می دهند تا حضور، شدت، و یا بهبودی از یک شرایطی را با بهبود صحت و دقت ارزیابی کنند. 7

خلاصه

یک طیف گسترده ای از بیومارکرهای قلبی مبتنی بر پروتئین، موفقیت در کاربردهای تشخیصی و پیش گویانه را نشان داده اند، به طوری که چندین مورد به عنوان اندازه گیری های روتین در آزمایشگاه های بالینی تایید شده اند. تلاش های پژوهشی گسترده اخیرا برای افزایش دانش اخیر در مورد برهم کنش های بیماری قلبی عروقی – پروتئین در حال انجام هستند که توسط سازمان های پروتئومی محور هدایت می شود مانند سازمان پروتئوم انسانی (HUPO). گل سر سبد آن ها، پروژه ی پروتئومی انسانی (HPP) بود که در حال کار برای نقشه ریزی کامل پروتئوم انسانی برای درک بیشتر بیولوژی سیستم های پروتئین ها و برهم کنش های پروتئین – پروتئین برای تشخیص، پیش گویی و نقش های درمانی در بیماری می باشد. 2 به ویژه، HUPO روی نیاز برای توسعه ی داده ها پایگاه های رایگان که اشتراک داده های پژوهشی را در کل سازمان ها برای بیان جزئیات کتابخانه ی پروتئومی انسانی ممکن می سازند تاکید کرده است. 159

INTRODUCTION

It is estimated that in excess of 20,000 proteincoding genes are responsible for the presence of more than 1 million proteins found in biological matrices.1 The measurement of these proteins, commonly in plasma, serum, urine, saliva, and tissue samples,2 has provided critical advancements in medical science through the development of diagnostic and prognostic assays for patients presenting with, or at risk of, a multitude of diseases.3 The use of protein measurements has been particularly beneficial for the assessment of cardiovascular disease, with the notable inclusion of natriuretic peptides and troponin isoforms in clinical decision making for heart failure (HF)4 and acute coronary syndromes (ACS),5 respectively. Clinical measurements of endogenous biological substances, such as proteins, lipids, and metabolites, are commonly referred to as biomarkers and provide pathophysiologic information through an associative or direct mechanistic interaction with the diseased system, organ, or tissue.6 The relationships of protein biomarkers with disease allow physicians to assess the presence, severity, and/ or prognosis of a condition with improved precision and accuracy.

SUMMARY

A wide range of protein-based cardiac biomarkers have shown success in diagnostic and prognostic applications, with several already established as routine measurements in clinical laboratories. Extensive research efforts are currently underway to enhance the current knowledge of protein–cardiovascular disease interactions, led by proteomic-based organizations such as Human Proteome Organization (HUPO). The flagship venture has been The Human Proteome Project (HPP), which is working to map the entire human proteome to further understanding of the localized and systems biology of proteins and protein-protein interactions for diagnostic, prognostic, and therapeutic roles in disease.2 In particular, HUPO has emphasized the need to develop open-access databases that allow the sharing of proteomics research data across equipment and institutions to detail the human proteome library.159

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

نشانگرهای زیستی پروتئومیکس در نارسایی قلبی

Proteomic Biomarkers of Heart Failure