این مقاله انگلیسی ISI در نشریه ساینس دایرکت (الزویر) در 9 صفحه در سال 2016 منتشر شده و ترجمه آن 21 صفحه میباشد. کیفیت ترجمه این مقاله ویژه – طلایی ⭐️⭐️⭐️ بوده و به صورت کامل ترجمه شده است.

مشخصات مقاله انگلیسی (PDF)
سال انتشار	2016
تعداد صفحات مقاله انگلیسی	9 صفحه با فرمت pdf
رشته های مرتبط با این مقاله	زیست شناسی و صنایع غذایی
گرایش های مرتبط با این مقاله	ژنتیک، علوم سلولی و مولکولی، علوم گیاهی و زیست فناوری مواد غذایی
مجله	کنترل غذا – Food Control
دانشگاه	اوبرشلایسهایم، آلمان
کلمات کلیدی	غذای اصلاح شده ژنتیکی، DdPCR در مقابل qPCR، مهارکننده های PCR
شناسه شاپا یا ISSN	ISSN 0956-7135
رفرنس	دارد ✓
لینک مقاله در سایت مرجع	لینک این مقاله در نشریه Elsevier
نشریه الزویر

• فهرست مطالب:

چکیده

1-مقدمه

2- مواد و روش ها

2-1- نمونه ها

2-2- استخراج DNA

2-3- الیگونوکلئوتیدها

2-4- ddPCR

2-4-1- تعیین مقدار GM

2-5- qPCR

2-6- تجزیه و تحلیل داده

2-7- روش های بازدارنده PCR

2-8- بررسی مواد GM مرجع

2-9- تولید غلظت های مختلف از مواد GM

3- نتایج و بحث

3-1- تجزیه و تحلیل ddPCR نمونه های حاوی درصدهای مختلف از مواد گیاهی GM

3-2- تایید محتوای GM چندین ماده مرجع GM

3-3- تاثیر بازدارنده ها بر PCR با استفاده از real-time و پلت فرم های دیجیتال قطره ای

3-4- ddPCR روی پلت فرم دوبلکس

3-5- ddPCR برای تولید غلظت های مختلف GMO

4- نتیجه گیری

• بخشی از ترجمه:

4- نتیجه گیری

این پژوهش کاربردی بودن روش های ddPCR برای تجزیه و تحلیل معمول مواد غذایی و خوراک GM را نشان می دهد. بررسی مواد مرجع با ddPCR، گواهی شده در سطوح مختلف محتوای GM، با محتوای GM بین حدود قابل قبول صحت، دقت و درستی، عملکرد خوبی را نشان داد. در آزمایش های بازدارندگی، ddPCR مقاومت بیشتری را به SOS به عنوان مهارکننده نشان داد و مقاومت به اتانول مشاهده شده برای دو سیستم PCR، قابل مقایسه بود. در نهایت، با استفاده از ddPCR، غلظت های مختلف DNA تراریخته، از محلول های 100% GM و غیر GM، با نتایج خوب تولید شد. پژوهش ما نشان داد که ddPCR می تواند یک ابزار قدرتمند در شناسایی و کمیت سنجی معمول غذاهای اصلاح شده ژنتیکی باشد.

• بخشی از مقاله انگلیسی:

4. Conclusion

This study demonstrates the applicability of ddPCR assays for the routine analysis of GM food and feed. The examination of reference material with ddPCR, certified at varying levels of GM content, showed good performance, with the measured GM content lying well within acceptable boundaries of trueness, accuracy and precision. In inhibition tests, ddPCR showed more tolerance to SDS as inhibitor, with comparable tolerance to ethanol observed for both PCR systems. Finally, applying ddPCR, different concentrations of GM DNA from 100% GM and non-GM DNA solutions were generated, with good results. Our study indicates that ddPCR can be a powerful tool in the routine identification and quantification of genetically modified foods.

دانلود رایگان مقاله انگلیسی

خرید ترجمه فارسی مقاله با فرمت ورد

نوشته دانلود ترجمه مقاله PCR دیجیتال قطره ای برای تحلیل غذاهای اصلاح شده ژنتیکی (ساینس دایرکت – الزویر 2016) (ترجمه ویژه – طلایی ⭐️⭐️⭐️) اولین بار در ترجمه فا پدیدار شد.

• فهرست مطالب:

مواد و روش ها

استراتژی جستجو

استخراج داده ها و ارزیابی خطر سوگیری

نتایج

تقدیر و تشکر

• بخشی از ترجمه:

بر اساس شواهدی که در این بررسی ارائه شده است، ما بر این باوریم که PCR در خون ممکن است نقش مهمی در بهبود نتیجه بیماران مبتلا به IC از طریق تشخیص زودهنگام و حساستر داشته باشد. با توجه به تجزیه و تحلیل ارائه شده، آزمایش بیماران مشکوک به IC باید با PCR همراه باشد اما جایگزین کشت خون نیست و نمونه گیری سریالی برای بیماران با خطر بالای IC باید در نظر گرفته شود. PCR با هدف تعیین عناصر DNA پانفونگال، که منجر به شناسایی گونه می شود ، باید برای نمونه های خون کامل اعمال شود. این آزمایش باید دارای حداقل حساسیت in vitro ، CFU / ml 10 باشد. از آنجایی که بسیاری از آزمایشات با PCR پانفونگال (توالی DNA ریبوزومی بین S 18 و S 5.8) شروع می شود، برای تشخیص زودهنگام آسپرژیلوز مهاجم (53) و IC در بیماران هماتولوژی، آزمایشات مشابه می توانند مورد استفاده قرار گیرند. به طور خلاصه، این مقاله مروری که دقت تشخیصی را مورد ارزیابی قرار می داد، نشان داد که PCR مستقیم در نمونه های خون ممکن است حساسیت بیشتری(90٪ ) برای تشخیص IC نسبت به کشت خون معمولی داشته باشد، که این میزان حساسیت برای عمل بالینی قابل قبول است. مطالعات آینده باید اثرات بالینی این آزمون را ارزیابی کند.

• بخشی از مقاله انگلیسی:

Based on the evidence compiled in this review, we believe that PCR in blood might play an important role in improving the outcome of patients with IC through earlier and moresensitive diagnosis. Given the analysis presented, testing of patients with suspected IC by PCR should accompany, but not replace, blood cultures, and serial sampling might be considered for patients at high risk for IC. PCR targeting panfungal DNA elements, with subsequent species identification, should be applied to whole-blood samples. The assay should have an in vitro sensitivity of at least 10 CFU/ml. Since many assays start with panfungal PCR (a ribosomal DNA sequence between 18S and 5.8S), the same assay can be used for early diagnosis of invasive aspergillosis (53) and IC in hematology patients. In summary, this diagnostic-accuracy review demonstrated that direct PCR in blood samples may have higher sensitivity for the diagnosis of IC than conventional blood cultures, with a specificity of 90%, which is acceptable for clinical practice. Future studies should assess the clinical effects of this test.

دانلود رایگان مقاله انگلیسی

خرید ترجمه فارسی مقاله با فرمت ورد

نوشته دانلود ترجمه مقاله کاربرد PCR در تشخیص کاندیدیازیس تهاجمی – Ncbi 2011 اولین بار در ترجمه فا پدیدار شد.

مشخصات مقاله انگلیسی (PDF)
سال انتشار مقاله	2008
تعداد صفحات مقاله انگلیسی	11صفحه با فرمت pdf
رشته های مرتبط با این مقاله	زیست شناسی
گرایش های مرتبط با این مقاله	ژنتیک، جانورشناسی و علوم سلولی و مولکولی
مجله مربوطه	مرزها در جانورشناسی – Frontiers in Zoology
دانشگاه تهیه کننده	گروه زیست شناسی، دانشگاه اسلو، نروژ
شناسه شاپا یا ISSN	ISSN 1742-9994
لینک مقاله در سایت مرجع	لینک این مقاله در سایت BMC
نشریه BMC

• فهرست مطالب:

چکیده

پیشینه

روش‌ها

طراحی پرایمر

نمونه‌برداری و استخراج DNA

آزمون پرایمر‌های ممانعت‌کننده

تکثیر DNA شکار از معده‌ی کریل با PCR

شناسایی کلون‌ها

نتایج

عملکرد پرایمرهای ممانعت‌کننده

بررسی معده‌ی کریل

بحث

نتیجه‌گیری

•  بخشی از ترجمه:

بحث

این بررسی نشان می‌دهد که حذف کامل توالی شکارچی می‌تواند از طریق افزودن پرایمرهای ممانعت‌کننده‌ی ویژه‌ی آن به مخلوط PCR صورت بگیرد. گرچه تکنیک‌های پیچیده‌ی توالی‌یابی مانند pyrosequencing [46] و polony sequencing [47] امروزه امکانات جدیدی در ردیابی تنوع توالی در نمونه‌های مخلوط مهیا کرده‌اند [48]، روشی برای حذف توالی‌ای که بیش از 1000برابر توالی‌های دیگر در نمونه حضور دارد، بسیار مفید خواهد‌بود. افزودن یک پرایمر ممانعت‌کننده‌ی ویژه‌ی توالی شکارچی نیز یک روش ساده برای تکثیر همه‌ی توالی‌های مربوط به جانوران شکار در نمونه‌ی معده جانور شکارچی می‌باشد. به‌علاوه، این روش نیازی به هیچ پیش‌آگاهی از جانوران شکار ندارد بلکه تنها توالی‌ای که باید از پیش دانسته‌شود، توالی مربوط به خود شکارچی است. در این بررسی همچنین ما نشان دادیم که یک پرایمر DPO [41] که سمت 3′ آن مسدود شده نیز می‌تواند به عنوان پرایمر ممانعت‌کننده به کار رود. این امر ناحیه‌ای که می‌شود در آن به دنبال یک جایگاه اتصال پرایمر ممانعت‌کننده گشت را گسترش داده و بسیار مفید است به‌ویژه از آن رو که تلاش‌های اولیه برای استفاده از یک پرایمر مسدودکننده بین پرایمرهای رفت و برگشت کارآمد نبوده‌است.

• بخشی از مقاله انگلیسی:

Discussion

This study shows that complete removal of predator sequences could be achieved by adding a predator specific blocking primer to a PCR mixture. Even though more sophisticated sequencing techniques such as pyrosequencing [46] and polony sequencing [47] now open new possibilities in assessing sequence diversity of mixed templates [48], applying a method that screens away templates assumed to occur in 1000-fold excess compared to what you are looking for will certainly be beneficial. Adding a predator specific blocking primer is also a simple method that allows for using a single PCR to simultaneously amplify DNA from all prey items present in each stomach sample. Furthermore, it does not depend on tests being developed a priori for potential prey, the only sequence that is needed to be known, is the sequence of the predator itself. In this study we also show that a DPO primer [41] having the 3′ end blocked also could be used as a blocking primer. This extends the region to look for species-specific blocking sites and is very useful especially since initial trials with a krill specific ‘elongation arrest’ primer located between the forward and reverse universal primer did not work.

دانلود رایگان مقاله انگلیسی

خرید ترجمه فارسی مقاله با فرمت ورد

نوشته دانلود ترجمه مقاله بلاکینگ پرایمرها برای افزایش تکثیر توالی های نادر PCR در نمونه های مخلوط – 2008 BMC اولین بار در ترجمه فا پدیدار شد.

این مقاله انگلیسی ISI در نشریه الزویر در 8 صفحه در سال 2012 منتشر شده و ترجمه آن 22 صفحه میباشد. کیفیت ترجمه این مقاله ویژه – طلایی ⭐️⭐️⭐️ بوده و به صورت کامل ترجمه شده است.

• فهرست مطالب:

چکیده

1-مقدمه

2- مواد و روش ها

2-1- مواد گیاهی

2-2- استخراج DNA

2-3- آماده سازی نمونه های آزمایش

2-4- هم ترازی توالی های نوکلئوتیدی از ژن های صفت ردیابی شده در این مطالعه

2-5- طراحی آغازگرهای دژنره برای غربالگری GMO

2-6- شرایط PCR دژنره

3-نتایج

3-1- انتخاب اهداف PCR و طراحی آغازگرها

3-1-1- mCry3-F/R

3-1-2- mCP4ES-F/R

3-1-3- mPAT-F/R

3-1-4- mCry1A-F/R

3-2- گسترش روش PCR دژنره چهارگانه

3-3- کاربردی بودن روش PCR دژنره چهارگانه برای غربالگری نمونه های عملی

4-بحث

• بخشی از ترجمه:

4-بحث

در این پژوهش، روش PCR مولتی پلکس با استفاده از چهار آغازگر PCR دژنره انجام شد و تعدادی تفاوت و اصلاح در مقایسه با چند مقاله گزارش شده قبلی وجود داشت (Dorries et al., 2010; Grohmann et al., 2009; Mano et al., 2009a; Randhawa et al., 2009)، مانند: پوشش اهداف تست شده، استراتژی غربالگری مبتنی بر ژن های برون زاد صفت و آغازگرهای دژنره برای ژن های مختلف با توالی های DNA بسیار همگن.

در سنجش های مولتی پلکس قبلا گزارش شده، یک نوع از روش ها برای غربالگری سریع وجود محتوی GM، با استفاده از برخی از عناصر مورد استفاده ی معمول (راه انداز، NOS، زن نشانگر و غیره) انجام شد (Bahrdt et al., 2010; Dorries et al., 2010; Lu et al., 2010; Randh awa et al., 2009). سایر روش ها با استفاده از توالی های اختصاصی ساختار یا توالی های منحصر به فرد اختصاصی رویداد، رویدادهای گیاهی تراریخته را به طور خاص شناسایی کردند (Nadal, Coll, La Paz, Esteve, & Pia, 2006; Shrestha, Hwu, Wang, Liu, & Chang, 2008). برای آزمایش های مولتی پلکس غربالگری، 100GMO مورد تایید می تواند ردیابی شده و همچنین برای تجزیه و تحلیل معمول در چندین آزمایشگاه استفاده می شود. روش های مولتی پلکس بسیار تخصصی رویدادهای GM مختلف به طور کلی برای تشخیص یک رویداد، مانند روش مولتی پلکس برای 8 ذرت تراریخته (Btl 1, Eventl 76, GA21, MON810, MON863, NK603, T25 و TC1507) استفاده می شوند (Shrestha, Hwu, Wang, Liu, & Chang, 2008).

• بخشی از مقاله انگلیسی:

4. Discussion

In this work, the multiplex PCR assay was established employing four degenerate PCR primers, and there were some differences and improvements compared with several previously reported papers (Dörries et al., 2010; Grohmann et al., 2009; Mano et al., 2009a; Randhawa et al., 2009), such as the tested targets coverage, the screen strategy based on the exogenous trait genes, and the degenerate primers targeted at the different genes with high homogenous DNA sequences.

In the previously reported multiplex assays, one kind of assay was for quickly screening the existence of the GM contents employing some commonly used elements (promoter, NOS, marker gene, etc.) (Bahrdt et al., 2010; Dörries et al., 2010; Lu et al., 2010; Randhawa et al., 2009); the other assays were specifically identified the detail GM plant events employing the construct-specific sequences or unique event-specific sequences (Nadal, Coll, La Paz, Esteve, & Pla, 2006; Shrestha, Hwu,Wang, Liu, & Chang, 2008). For the screen multiplex assays, 100 approved GMOs can be detected, and which were also used for the routine analysis in several labs. The high specific multiplex assays of different GM events were generally used for concrete identifying of one event, such as the multiplex assay for eight GM corns (Bt11, Event176, GA21, MON810, MON863, NK603, T25,and TC1507) (Shrestha, Hwu, Wang, Liu, & Chang, 2008).

دانلود رایگان مقاله انگلیسی

خرید ترجمه فارسی مقاله با فرمت ورد

نوشته دانلود ترجمه مقاله روش تحلیلی PCR مالتی پلکس دژنره برای 8 ژن هدف – مجله الزویر اولین بار در ترجمه فا پدیدار شد.

این مقاله انگلیسی ISI در نشریه اسپرینگر در 17 صفحه در سال 2006 منتشر شده و ترجمه آن 28 صفحه میباشد. کیفیت ترجمه این مقاله ویژه – طلایی ⭐️⭐️⭐️ بوده و به صورت کامل ترجمه شده است.

• فهرست مطالب:

چکیده

اختصارات

مقدمه

مواد و روش ها

ماده نمونه

گیاهان

خالص سازی DNA

PCR و برچسب زنی

طراحی ریزآرایه با چگالی کم

هیبریداسیون آرایه DNA و تشخیص رنگ سنجی

نتایج

تکثیر توافقی

اختصاصی بودن روش

حساسیت روش برای یک آزمون GMO انفرادی

حساسیت روش در یک مخلوط GMO حاوی Btl 1, CBH351, RRS و GA21

حساسیت روش در یک مخلوط GMO حاوی MON810, T25, T45 و Topasl9/2

بحث

• بخشی از ترجمه:

بحث

تاکید خاص بر کاهش تعداد واکنش های مورد نیاز PCR و تعداد آغازگر حاضر در هر لوله تکثیر بود. به منظور کاهش تعداد PCR، دو نوع PCR توسعه داده شد و در ترکیب با آغازگرهای مشترک یا آغازگرهای اختصاصی برای عناصر ژنتیکی موجود در رویدادهای GM استفاده شد. چندین آغازگر برای هیبرید شدن در عناصر کوچک حفاظت شده مانند P-35S, T-35S  و T-nos و برای تکثیر همزمان GMO های مختلف طراحی شدند. Btll, CBH351 و RRS با استفاده از جفت آغازگرهای یکسان OPP35SI و OPT nos2 که برای هیبرید کردن به ترتیب عناصر P-35S  و T-nos طراحی شده بودند، تکثیر شدند. یک پرایمر طراحی شده داخل توالی T-35S (OPT352) در ترکیب با پرایمرهای طراحی شده در P-35S، باعث تکثیر 4 GMO دیگر: Btl 76, T25, T45 و Topasl9/2 شد. برای تکثیر GA21 و MON810، دو جفت آغازگر اختصاصی استفاده شد. برای تکثیر عناصر غربالگری P-35S و T-nos، یک سیستم PCR دوبلکس با استفاده از دو جفت آغازگر اختصاصی توسعه داده شد. برای تشخیص گونه های گیاهی، دو جفت آغازگر دجنره شده که برای تکثیر ساکارز سنتاز و ژن فعال کننده ی روبیسکو طراحی شده بود، در هر لوله ی PCR استفاده شد. تمایز بین محصولات مختلف PCR با استفاده از ریزآرایه مشخص شد.

• بخشی از مقاله انگلیسی:

Discussion

Particular emphasis was placed on the reduction of the number of PCR reactions required and on the number of primers present per amplification tube. To reduce the number of PCR, two types of PCR were developed and used in combination: either consensus primers or specific primers for genetic elements present in the GM events. Several primers were designed to hybridize in small conserved elements such as P-35S, T-35S and T-nos and to allow amplification of different GMOs simultaneously. Bt11, CBH351 and RRS were amplified with the same primer pairs: OPP35S1 and OPTnos2 which were designed to hybridize P-35S and T-nos elements, respectively. A primer designed within the sequence of the T-35S (OPT352)allowed, in combination with the primers designed in the P-35S, the amplification of four other GMOs: Bt176, T25, T45 and Topas19/2. For the amplification of GA21 and MON810, two specific primer pairs were used. For the amplifications of the screening elements P-35S and T-nos, a duplex PCR system using two specific primer pairs was developed. For the detection of plant species, two degenerated primer pairs designed to amplify both sucrose synthase and rubisco activase genes were used in a single PCR tube. The discrimination between the different PCR products was realized by the use of the micro-array.

دانلود رایگان مقاله انگلیسی

خرید ترجمه فارسی مقاله با فرمت ورد

نوشته دانلود ترجمه مقاله سیستم تشخیص مبنی بر ریزآرایه مواد غذایی اصلاح شده ژنتیکی – نشریه اسپرینگر اولین بار در ترجمه فا پدیدار شد.

این مقاله انگلیسی ISI در نشریه Agriculturejournals در 7 صفحه در سال 2014 منتشر شده و ترجمه آن 10 صفحه میباشد. کیفیت ترجمه این مقاله ویژه – طلایی ⭐️⭐️⭐️ بوده و به صورت کامل ترجمه شده است.

• فهرست مطالب:

چکیده

مقدمه

مواد و روش ها

نتایج و بحث

• بخشی از ترجمه:

نتایج و بحث

پس از PCR مستقیم با آغازگرهای عمومی Pl/P7 ، هیچ محصول PCR به دست نیامد. PCR آشیانه ای با محصولات به دست آمده از R16F2n/R16R2 با اندازه مورد انتظار (2/1- کیلوباز) از 19 نمونه سیب و از استرین های مرجع AP-15 و AY2192 انجام شد (داده ها نشان داده نشده است). 15 نمونه (SzamP, Mut, GoP, GoC, J629, GIP, JoC, RBoC, Kotl, J8148, Przel, J4020, Oz, Bor و Kijak) در PCR آشیانه ای با استفاده از آغازگر R16(X)Fl/Rl اختصاصی برای فیتوپلاسمای به دست آمده از گروه جاروک سیب (16SrX)، آزمایش شدند. PCR آشیانه ای با جفت پرایمرهای R16(I)Fl/ Rl اختصاصی برای فیتوپلاسمای گروه زردی گل مینا (16Srl) منجر به محصولاتی برای 4 نمونه دیگر شد (Pin, Evel, DKil/4 و DKil/6). هیچ محصولی از DNA گیاهان سالم تکثیر نشد. درختان سیب آلوده موجود در باغ ها، باغ های خانگی و شرایط طبیعی واقع تمام 6 منطقه مورد مطالعه از لهستان قرار داشتند، که نشان می دهد که بیماری های فیتوپلاسمایی در بسیاری از مناطق تولید سیب توزیع شده اند.

• بخشی از مقاله انگلیسی:

RESULTS AND DISCUSSION

No PCR products were obtained after direct-PCR with the P1/P7 universal primers. Nested PCR primed by R16F2n/R16R2 yielded products of the expected size (~1.2 kb) from 19 apple samples and from the reference strains AP-15 and AY2192 (data not shown). Fifteen samples (SzamP, Mut, GoP, GoC, J629, GlP, JoC, RBoC, Kotl, J8148, Przel, J4020, Oz, Bor, and Kijak) were positively tested in nested PCR with primers R16(X)F1/R1 specific for phytoplasmas from apple proliferation group (16SrX). Nested PCR with primers pair R16(I)F1/ R1 specific for aster yellows group phytoplasma (16SrI) resulted in products for other four samples (Pin, Evel, DKII/4, and DKII/6). No products were amplified from DNAs of healthy plants. The infected apple trees were grown in orchards, home gardens and natural environments located in all six surveyed voivodeships of Poland, which suggests that phytoplasmal diseases are distributed in most of the apple production regions.

دانلود رایگان مقاله انگلیسی

خرید ترجمه فارسی مقاله با فرمت ورد

نوشته دانلود ترجمه مقاله شناسایی مولکولی درختان سیب آلوده به فیتوپلاسما اولین بار در ترجمه فا پدیدار شد.