دانلود ترجمه مقاله بلاکینگ پرایمرها برای افزایش تکثیر توالی های نادر PCR در نمونه های مخلوط – ۲۰۰۸ BMC

مشخصات مقاله انگلیسی (PDF)
سال انتشار مقاله	۲۰۰۸
تعداد صفحات مقاله انگلیسی	۱۱صفحه با فرمت pdf
رشته های مرتبط با این مقاله	زیست شناسی
گرایش های مرتبط با این مقاله	ژنتیک، جانورشناسی و علوم سلولی و مولکولی
مجله مربوطه	مرزها در جانورشناسی – Frontiers in Zoology
دانشگاه تهیه کننده	گروه زیست شناسی، دانشگاه اسلو، نروژ
شناسه شاپا یا ISSN	ISSN ۱۷۴۲-۹۹۹۴
لینک مقاله در سایت مرجع	لینک این مقاله در سایت BMC
نشریه BMC

• فهرست مطالب:

چکیده

پیشینه

روش‌ها

طراحی پرایمر

نمونه‌برداری و استخراج DNA

آزمون پرایمر‌های ممانعت‌کننده

تکثیر DNA شکار از معده‌ی کریل با PCR

شناسایی کلون‌ها

نتایج

عملکرد پرایمرهای ممانعت‌کننده

بررسی معده‌ی کریل

بحث

نتیجه‌گیری

•  بخشی از ترجمه:

بحث

این بررسی نشان می‌دهد که حذف کامل توالی شکارچی می‌تواند از طریق افزودن پرایمرهای ممانعت‌کننده‌ی ویژه‌ی آن به مخلوط PCR صورت بگیرد. گرچه تکنیک‌های پیچیده‌ی توالی‌یابی مانند pyrosequencing [46] و polony sequencing [47] امروزه امکانات جدیدی در ردیابی تنوع توالی در نمونه‌های مخلوط مهیا کرده‌اند [۴۸]، روشی برای حذف توالی‌ای که بیش از ۱۰۰۰برابر توالی‌های دیگر در نمونه حضور دارد، بسیار مفید خواهد‌بود. افزودن یک پرایمر ممانعت‌کننده‌ی ویژه‌ی توالی شکارچی نیز یک روش ساده برای تکثیر همه‌ی توالی‌های مربوط به جانوران شکار در نمونه‌ی معده جانور شکارچی می‌باشد. به‌علاوه، این روش نیازی به هیچ پیش‌آگاهی از جانوران شکار ندارد بلکه تنها توالی‌ای که باید از پیش دانسته‌شود، توالی مربوط به خود شکارچی است. در این بررسی همچنین ما نشان دادیم که یک پرایمر DPO [41] که سمت ۳′ آن مسدود شده نیز می‌تواند به عنوان پرایمر ممانعت‌کننده به کار رود. این امر ناحیه‌ای که می‌شود در آن به دنبال یک جایگاه اتصال پرایمر ممانعت‌کننده گشت را گسترش داده و بسیار مفید است به‌ویژه از آن رو که تلاش‌های اولیه برای استفاده از یک پرایمر مسدودکننده بین پرایمرهای رفت و برگشت کارآمد نبوده‌است.

• بخشی از مقاله انگلیسی:

Discussion

This study shows that complete removal of predator sequences could be achieved by adding a predator specific blocking primer to a PCR mixture. Even though more sophisticated sequencing techniques such as pyrosequencing [46] and polony sequencing [47] now open new possibilities in assessing sequence diversity of mixed templates [48], applying a method that screens away templates assumed to occur in 1000-fold excess compared to what you are looking for will certainly be beneficial. Adding a predator specific blocking primer is also a simple method that allows for using a single PCR to simultaneously amplify DNA from all prey items present in each stomach sample. Furthermore, it does not depend on tests being developed a priori for potential prey, the only sequence that is needed to be known, is the sequence of the predator itself. In this study we also show that a DPO primer [41] having the 3′ end blocked also could be used as a blocking primer. This extends the region to look for species-specific blocking sites and is very useful especially since initial trials with a krill specific ‘elongation arrest’ primer located between the forward and reverse universal primer did not work.

دانلود رایگان مقاله انگلیسی

خرید ترجمه فارسی مقاله با فرمت ورد