دانلود ترجمه مقاله تحلیل تبارزایش مولکولی ارقام زیتون Olea europaea L. subsp. europaea

این مقاله انگلیسی ISI در ۸ صفحه در سال ۲۰۱۳ منتشر شده و ترجمه آن ۱۱ صفحه میباشد. کیفیت ترجمه این مقاله ویژه – طلایی ⭐️⭐️⭐️ بوده و به صورت کامل ترجمه شده است.

• فهرست مطالب:

چکیده

مقدمه

مواد و روش ها

ماده گیاهی

استخراج DNA و تکثیر PCR

تحلیل داده ها

نتایج و بحث

پروفایل های RAPD-DNA

تحلیل داده ها

• بخشی از ترجمه:

تحلیل داده ها

تجزیه و تحلیل داده ها بر اساس نتایج گرفته شده از عکس های ژل آگارز برای هر آغازگر بود. فقط باندهای مرئی برای تجزیه و تحلیل داده ها مورد بررسی قرار گرفتند. آنالیزهای فیلوژنتیک و فنتیک در یک ماتریس داده شامل ویژگی های با عدد ‘۱’ برای وجود باند و ‘۰’ برای عدم وجود باند روی عکس های ژل انجام شد. برای تجزیه و تحلیل داده های RAPD-DNA، در تمام هفت آغازگر ۸۴ ویژگی/باند محقق شده بود. آغازگرها حداکثر دوازده صفت را تولید کردند. ماتریس داده ها می تواند بر اساس درخواست نویسنده ارائه شود. ماتریس داده ها برای استفاده در نرم افزار PAUP*، نسخه ۴٫۰blO به فرمت #NEXUS تبدیل شدند.

در طول تجزیه و تحلیل، از parsimony و فاصله ژنتیکی (حداقل تکامل) استفاده شد. در تجزیه و تحلیل parsimony از الگوریتم Branch-and-Bound استفاده شد و ۴۵ ویژگی ثابت از ۸۴ ویژگی، ۲۰ ویژگی متغیر بدون اطلاعات و ۱۹ ویژگی متغیر حاوی اطلاعات نشان داده شد. تمام ویژگی ها با یک اندازه مشخص وزن-دهی شده و ۱۰۰۰۰ درخت در طول تجزیه و تحلیل در حافظه نگهداری شدند، در حالی که تمام توپولوژی های درخت بدون محدودیت مورد بررسی قرار گرفتند. در تجزیه و تحلیل ۸ درخت parsimonious با ۶۵ مرحله وجود داشت. شکل ۲ درخت شماره ۱ از ۸ درخت parsimonious را نشان می دهد. این ۸ درخت به یک اندازه parsimonious بوده و درخت شماره یک، به دلیل شباهت آن به درخت neighbor joining (NJ)  از بین آن ها انتخاب شد (شکل ۲ و ۳). به منظور ارزیابی آماری در شاخه های فردی، تجزیه و تحلیل بوت استرپ (Felsenstein 1985) انجام شد و شاخه های با بوت استرپ بالاتر یا پایین تر از ۵۰ درصد زیر شاخه های شکل ۲ نشان داده شده است.

• بخشی از مقاله انگلیسی:

DATA ANALYSIS

Analysis of data was based on the results taken from the agarose gel photos for each primer. Only visible bands were evaluated for data analysis. Phylogenetic and phenetic analyses were performed on a data matrix comprising characters scored as ‘۱’ for presence of the band and ‘۰’ for absence of the band on the gel photos. For the analysis of RAPD-DNA data, in all seven primers with 84 characters/ bands were attained. Primers generated maximum twelve characters. Data matrix can be presented upon request by the corresponding author. Data matrix was converted to #NEXUS format for the application in PAUP* software, Version 4.0b10.

During the analysis, parsimony and genetic distance (minimum evolution) criteria were used. Parsimony analysis used Branch-and-Bound algorithm and revealed 45 constant characters out of 84 characters, 20 variable parsimony-uninformative characters and 19 variable parsimony-informative characters. All characters were weighted equally and 10000 trees were kept in memory through the analysis, while all tree topologies were evaluated without constraints. Analysis yielded 8 most parsimonious trees with 65 steps. Figure 2 shows tree number 1 of 8 most parsimonious trees. These 8 trees were equally most parsimonious and the tree number one was chosen among them due to its similarity to neighbor joining (NJ) tree (cf. Figures 2 and 3). In order to assess the statistical supports on individual branches, a Bootstrap analysis (Felsenstein 1985) was performed and branches getting Bootstrap supports higher or lower than 50% were shown in numbers below branches on Figure 2.

دانلود رایگان مقاله انگلیسی

خرید ترجمه فارسی مقاله با فرمت ورد