بیماری وردینگ هافمن (SMA): به روز رسانی در مورد پیشرفت درمانی

Spinal muscular atrophy: An update on therapeutic progress

• برای دانلود رایگان مقاله انگلیسی با فرمت pdf بر روی عنوان انگلیسی مقاله کلیک نمایید.
• برای خرید و دانلود ترجمه فارسی آماده با فرمت ورد، روی عنوان فارسی مقاله کلیک کنید.

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

بیماری وردینگ هافمن (SMA): به روز رسانی در مورد پیشرفت درمانی

Spinal muscular atrophy: An update on therapeutic progress

• برای دانلود رایگان مقاله انگلیسی با فرمت pdf بر روی عنوان انگلیسی مقاله کلیک نمایید.
• برای خرید و دانلود ترجمه فارسی آماده با فرمت ورد، روی عنوان فارسی مقاله کلیک کنید.

 کاربردهای درمانی ریبوزیم ها و ریبوسوییچ ها

Therapeutic applications of ribozymes and riboswitches

مقدمه

کاربردهای درمانی ریبوزیم

استراتژی ضد سرطان مبتنی بر ریبوزیم

استراتژی ضد ویروس مبتنی بر ریبوزیم

استراتژی ضد پریون مبتنی بر ریبوزیم

کاربردهای درمانی ریبوسوئیچ

ریبوسوئیچ TPP

ریبوسوئیچ لیزین

ریبوسوئیچ FMN

ریبوسوئیچ گوانین

نتیجه گیری

منابع

روش های درمانی با استفاده از RNA به عنوان یک ابزار یا یک هدف دارویی است که به تازگی ظاهر شده و برای کاربردهای مختلف، از درمان سرطان تا عفونت ویروسی استفاده شده است. ثابت شده است که RNA علیرغم کمبود گروه های مولکولی در مقایسه با پروتئین ها، انتخاب خوبی برای محققانی است که تمایل به گسترش ابزارهای درمانی دارند. ریبوزیم ها و ریبوسوئیچ ها ابزارهای درمانی مبتنی بر RNA هستند که اغلب به منظور کاهش بیان ژن و مهار عفونت های باکتریایی به کار می روند. هدف این بررسی ارائه ی خلاصه ای از پیشرفت های اخیر در برنامه-های درمانی مبتنی بر ریبوزیم و ریبوسوئیچ است که در برخی موارد به آزمایشات بالینی رسیده است.

نتیجه گیری

ریبوزیم ها و ریبوسوئیچ ها روش های درمانی جدیدی را برای درمان بیماری های انسانی ارائه می دهند. استفاده از ریبوزیم ها به عنوان یک جایگزین امیدوارکننده به جای تکنولوژی RNAi هستند، زیرا هیچ ضربه ی غیرهدفی از آن ها هنوز دیده نشده است [19،60]. برای ریبوزیم سرچکشی، حداقل 12 نوکلئوتید مکمل برای تشکیل/ هیبریداسیون ریبوزیم با یک شکاف تک نوکلئوتیدی بین دو محل هیبریداسیون برای شکافت مورد نیاز است (61)، که احتمالا به دلیل اختصاصی بودن واکنش مهم است. علاوه بر این، ریبوسوئیچ های جدیدا کشف شده اهداف آنتی بیوتیکی جالب هستند، زیرا فرصت های جدیدی برای مبارزه با MDR ارائه می دهند. اولین تظاهرات کارایی آنها در یک مدل عفونت، باید باعث افزایش تلاش ها برای استفاده از آنها به عنوان اهداف آنتی بیوتیک شود. علاوه بر این، ریبوسوئیچ ها می توانند با استفاده از عناصر ژنتیکی RNA طراحی شده توسط SELEX برای کنترل تولید آنزیم در اختلالات ژنتیکی مورد استفاده قرار گیرند.

Therapeutic approaches employing RNA as a tool or as a drug target have recently emerged and have been employed for various applications—ranging from cancer treatment to virus infection. Despite the paucity of its molecular groups compared to proteins, RNA has nevertheless proved to be an excellent choice for researchers who have aspired to develop therapeutic tools. Ribozymes and riboswitches are RNA-based therapeutic tools that are most often employed to knockdown gene expression and to inhibit bacterial infections, respectively. The aim of this review is to summarize recent advances observed in ribozyme- and riboswitch-based therapeutic applications that, in some cases, have reached clinical trials.

Conclusions

Ribozymes and riboswitches offer new therapeutic approaches to address human diseases. The use of ribozymes appears to be a promising alternative to RNAi technology as no off-target hits have yet been observed [19,60]. For the hammerhead ribozyme, at least 12 complementary nucleotides are needed for the ribozyme hybridization/formation with a gap of one nucleotide between the two hybridization sites to allow cleavage [61], which is likely important for the specificity of the reaction. In addition, newly-discovered riboswitches are interesting antibiotic targets as they offer new opportu nities to fight MDR. The first demonstration of their efficiency in an infection model should promote attempts to use them as antibiotic targets. In addition, riboswitches could be employed to control enzyme production in genetic disorders by using SELEX-designed RNA genetic elements.

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

 کاربردهای درمانی ریبوزیم ها و ریبوسوییچ ها

Therapeutic applications of ribozymes and riboswitches

تنظیم بیان ژن AL2 و AL3 ویروس موزاییک طلایی گوجه فرنگی توسط یک قالب آزاد بالادست

Regulation of Tomato golden mosaic virus AL2 and AL3 gene expression by a conserved upstream open reading frame

چکیده

مقدمه

نتایج

ترجمه می تواند در cAL1 AUG آغاز شود

کدون های AUG در میان 5′-UTR از AL-1935 نقش مهاری در بیان TGMV AL2 و AL3 ایفا می-کنند.

جهش کدون AUG تاثیر ناچیزی بر رونویسی یا بیان خودمختار ویروسی دارد

جهش cAL1 بر بیماریزایی ویروس در اسفناج تاثیر می گذارد

جهش cal1 هیچ تاثیری بر بار ویروس ندارد

بیان AL3 از AL-1629 با کمک عبور سست ریبوزوم

بحث

مواد و روش ها

سازه های DNA

آلودگی پروتوپلاستی و آنالیز

الحاق در گیاه

چکیده

ویژگی مکانیزم تنظیمی ترجمه برای بیان ژن مکمل-سنس ویروس موزائیک طلایی گوجه فرنگی (TGMV)  تعیین شده است. TGMV دو رشته ی mRNA به نام های رونوشت AL-1935 و AL-1629 را رونویسی می کند که هر دوی آن ها دارای قالب های آزاد AL2 و AL3 هستند. اما AL2 تنها از AL-1629 بیان می شود در حالی که AL3 از هر دو ناحیه بیان می گردد. سه کدون آغازین ترجمه ی AUG در بالادست هر دو ناحیه ی کدگذاری AL2 و AL3 و میان ناحیه ی غیرترجمه ای (UTR)  از رونوشت AL-1935 قرار گرفته اند. ترجمه می تواند از اولین کدون AUG آغاز شود، که 122 اسیدآمینه ی انتهای C را در پروتئین AL1 (cAL1) مشخص می کند. آغاز ترجمه در این کدون AUG برای بیان پایین دست AL2 و AL3 مهارکننده است. علت این امر بیشتر به این موضوع برمی گردد که کدون خاتمه ی cAL1 پس از کدون آغازین AUG برای ORF مربوط به AL2 قرار گرفته است. مکانیزمی که بوسیله ی آن AL3 از AL-1935 بیان می شود، هنوز ناشناخته است اما فاصله ی بین کدون خاتمه ی cAL1 و شروع AL3 پیشنهاد می کند که می تواند در شروع مجدد و/یا آغاز داخلی بیان دخالت داشته باشد. در مقابل، بیان AL3 از AL-1629 به احتمال زیاد به وسیله ی عبور سست ریبوزم  اتفاق می افتد زیرا کدون آغازین AL3 قبل از کدون خاتمه ی AL2 قرار دارد. جهش در پروتئین cAL که کد کننده ی AUG در کورتوویروس، ویروس کرلی تاپ اسفناج ، منجر به کاهش کارایی می شود چون در دوره ی تاخیری کوتاهتری اندازه گیری شده است. روی هم رفته این موضوعات پیشنهاد می کند که ژمینی ویروس  از مکانیزم تنظیمی پس ترجمه ای برای تنظیم سنتز پروتئین های ویروسی که در همانندسازی و سرکوب دفاع میزبان اهمیت دارند، استفاده می کند.

مقدمه

ژنوم دوقسمتی ویروس طلایی گوجه فرنگی (TGMV)، یک بگومو ویروس ، متشکل از دو جزء DNA به نام های A و B است که حدوداً 6/2 کیلو باز دارد. همانندسازی ژنوم DNA تک رشته ای در هسته ی سلول های گیاهی آلوده رخ می دهد که درنتیجه یک حد واسط DNA دو رشته ای به شکل همانندساز (RF)  ایجاد می شود. mRNAهای اختصاصی ویروس از RF DNA به شکل دو جهتی رونویسی می شود و یک ناحیه با حدود 230 توکلئوتید را شکل می دهد که در دو جزء DNA مشترک است (شکل 1A). RNA های ویروسی پلی آدنیله هستند و پایین دست جعبه ی حفظ‌شده‌ی TATA و نیز عناصر آغازگر که نشانگر ترجمه به‌واسطه‌ی RNA پلی-مراز II میزبان هستند، را شروع می کنند. در حال حاضر مشخص نیست که آیا رونوشت های TGMV در انتهای 5́ کلاهک‌گذاری می شوند یا خیر. یک RNA ویروسی منفرد از DNA مربوط به TGMV رونویسی می شود که از نوکلئوتید 319 (AR-319) آغاز می شود، که الگو را برای ترجمه ی CP آماده می کند. رونویسی رشته ی مکمل-سنس پیچیده تر است، RNAهای همپوشانی را که واجد انتهاهای 5́ متفاوت و انتهای 3́ مشترکی هستند، ایجاد می کند. بزرگترینرونوشت از نوکلئوتید 62 (AL-62) شروع می شود، و کل نیمه ی سمت چپ TGMV A را کد می کند و تنها رونوشتی است که می تواند پروتئین AL1 با طول کامل را کد کند. اما AL-62 همچنین پتانسیل کد کردن پروتئین های AL2، AL3 و AL4 را دارد.

الحاق در گیاه

N. benthamiana سالم، آرابیدوپسیس یا اسفناج (Spinacea oleracea va. viroflay) با استفاده از یک دوز استاندارد (OD600=1.0) طبق آنچه قبلا توضیح داده شد، با کشت های اگروباکتریومی تلقیح شدند که دارای کپی های تکراری از DNA وحشی یا جهش یافته ی SCTV و یا TGMV بودند. گیاهان تلقیح شده از نظر ویژگی علائم عمومی عفونت یک SCTV یا TGMV روی بافت آلوده به شکل روزانه مورد ارزیابی قرار گرفتند. اندازه گیری دوره های تاخیری و ID50 طبق توضیحات قبلی انجام شد. DNA از گیاهان آلوده و سالم جدا شد و طبق توضیحات قبلی جهت تجمع DNA ویروسی مورد ارزیابی قرار گرفت.

Abstract

A translational regulatory mechanism for Tomato golden mosaic virus (TGMV) complementary-sense gene expression has been characterized. TGMV transcribes two mRNAs, AL-1935 and AL-1629 transcripts, both of which contain the AL2 and AL3 open reading frames. However, AL2 is only expressed from AL-1629 whereas AL3 is expressed from both. Three AUG translation initiation codons are located upstream of both the AL2 and AL3 coding regions, within the 5′-untranslated region (UTR) of the AL-1935 transcript. Translation can initiate at the first AUG, specifying the C-terminal 122 amino acids of the AL1 protein (cAL1). Initiation of translation at this AUG is inhibitory for the downstream expression of both AL2 and AL3. This is most likely due to the terminator codon of cAL1 being positioned after the AUG initiation codon for the AL2 ORF. The mechanism by which AL3 is expressed from AL-1935 is currently unknown but a gap between the cAL1 termination codon and the start of AL3 suggests that it may involve reinitiation and/or internal initiation. In contrast, expression of AL3 from AL-1629 most likely occurs via leaky ribosome scanning since the AL3 initiation codon occurs before the terminator codon of AL2. Mutation of the AUG encoding cAL1 in the curtovirus, Spinach curly top virus, leads to increased infectivity as measured by a shorter latent period. Together this suggests that geminiviruses use a post-translational regulatory mechanism to regulate the synthesis of viral proteins important for replication and suppression of host defenses.

Introduction

The bipartite genome of Tomato golden mosaic virus (TGMV), a begomovirus, consists of two DNA components, A and B, of approximately 2.6 kb (Hamilton et al., 1984). Replication of the single stranded DNA genome occurs in the nuclei of infected plant cells producing double-stranded (ds) DNA replicative form (RF) intermediates (Stenger et al., 1991). Virus-specific mRNAs are transcribed from RF DNA in a bidirectional manner from an approximately 230 nt region, common to both DNA components (Fig. 1A) (Fontes et al., 1994; Hanley-Bowdoin et al., 1990; Petty et al., 1988; Sunter and Bisaro, 1989; Sunter et al., 1989, 1993). Viral RNAs are polyadenylated and initiate downstream of either consensus TATA box or initiator elements indicative of transcription mediated by host RNA polymerase II. It is unknown at this time whether TGMV transcripts are capped at the 5′-end. A single virion-sense RNA is transcribed from TGMV DNA A initiating at nt 319 (AR-319), providing the template for translation of CP (Sunter et al., 1989). Complementary-sense transcription is more complex, producing multiple overlapping RNAs with different 5′-ends but a common 3′-end. The largest transcript initiates at nt 62 (AL-62), encodes the entire left side of TGMV A (Sunter et al., 1989), and is the only transcript that can encode full-length AL1 protein. However, AL-62 also has the potential to code for the AL2, AL3 and AL4 proteins.

Plant inoculation

Healthy N. benthamiana, Arabidopsis or spinach (Spinacea oleracea, var. viroflay) were inoculated with Agrobacterium cultures containing either tandemly repeated copies of wild type or mutant SCTV or TGMV DNA, using a standard dose (O.D.600 = 1.0) as described previously (Baliji et al. 2004). Inoculated plants were scored for the appearance of symptoms typical of an SCTV or TGMV infection on systemically infected tissue on a daily basis. Latent periods and ID50 measurements were made as described previously (Sunter et al., 2001). DNA was isolated from infected, and healthy mock-inoculated plants and analyzed for viral DNA accumulation as described previously (Baliji et al., 2007).

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

تنظیم بیان ژن AL2 و AL3 ویروس موزاییک طلایی گوجه فرنگی توسط یک قالب آزاد بالادست

Regulation of Tomato golden mosaic virus AL2 and AL3 gene expression by a conserved upstream open reading frame

تغییرات OprD در کرباپنم متوسط و سویه های حساس سودوموناس آئروژینوزا جدا شده از بیماران مبتلا به باکتری در یک مطالعه چند مرکزی اسپانیایی

Alterations of OprD in Carbapenem-Intermediate and -Susceptible Strains of Pseudomonas aeruginosa Isolated from Patients with Bacteremia in a Spanish Multicenter Study

• برای دانلود رایگان مقاله انگلیسی با فرمت pdf بر روی عنوان انگلیسی مقاله کلیک نمایید.
• برای خرید و دانلود ترجمه فارسی آماده با فرمت ورد، روی عنوان فارسی مقاله کلیک کنید.

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

تغییرات OprD در کرباپنم متوسط و سویه های حساس سودوموناس آئروژینوزا جدا شده از بیماران مبتلا به باکتری در یک مطالعه چند مرکزی اسپانیایی

Alterations of OprD in Carbapenem-Intermediate and -Susceptible Strains of Pseudomonas aeruginosa Isolated from Patients with Bacteremia in a Spanish Multicenter Study

• برای دانلود رایگان مقاله انگلیسی با فرمت pdf بر روی عنوان انگلیسی مقاله کلیک نمایید.
• برای خرید و دانلود ترجمه فارسی آماده با فرمت ورد، روی عنوان فارسی مقاله کلیک کنید.

متد جداسازی سريع باسیل خاک و غربال کردن فعالیت رفع حد نصاب آن ها

Rapid isolation method of soil bacilli and screening of their quorum quenching activity

• برای دانلود رایگان مقاله انگلیسی با فرمت pdf بر روی عنوان انگلیسی مقاله کلیک نمایید.
• برای خرید و دانلود ترجمه فارسی آماده با فرمت ورد، روی عنوان فارسی مقاله کلیک کنید.

مجله حوزه آسیا اقیانوسیه زیست شناسی مولکولی و بیوتکنولوژی

Asia Pacific Journal of Molecular Biology and Biotechnology

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

متد جداسازی سريع باسیل خاک و غربال کردن فعالیت رفع حد نصاب آن ها

Rapid isolation method of soil bacilli and screening of their quorum quenching activity

• برای دانلود رایگان مقاله انگلیسی با فرمت pdf بر روی عنوان انگلیسی مقاله کلیک نمایید.
• برای خرید و دانلود ترجمه فارسی آماده با فرمت ورد، روی عنوان فارسی مقاله کلیک کنید.

توسعه های اخیر در تفکیک گونه های مختلف گوشت – یک مرور

Recent Developments in Meat Species Speciation-a review

• برای دانلود رایگان مقاله انگلیسی با فرمت pdf بر روی عنوان انگلیسی مقاله کلیک نمایید.
• برای خرید و دانلود ترجمه فارسی آماده با فرمت ورد، روی عنوان فارسی مقاله کلیک کنید.

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

ارزیابی تحولات اخیر گونه زایی در گونه گوشت 

Recent Developments in Meat Species Speciation-a review

• برای دانلود رایگان مقاله انگلیسی با فرمت pdf بر روی عنوان انگلیسی مقاله کلیک نمایید.
• برای خرید و دانلود ترجمه فارسی آماده با فرمت ورد، روی عنوان فارسی مقاله کلیک کنید.

ارتباط بین ژن CD36 پلی مورفیسم و استعداد ابتلا به بیماری قلبی عروق کرونر

Associations between CD36 gene polymorphisms and susceptibility to coronary artery heart disease

• برای دانلود رایگان مقاله انگلیسی با فرمت pdf بر روی عنوان انگلیسی مقاله کلیک نمایید.
• برای خرید و دانلود ترجمه فارسی آماده با فرمت ورد، روی عنوان فارسی مقاله کلیک کنید.

ارتباط بین ژن CD36 پلی مورفیسم و استعداد ابتلا به بیماری قلبی عروق کرونر

Associations between CD36 gene polymorphisms and susceptibility to coronary artery heart disease

• برای دانلود رایگان مقاله انگلیسی با فرمت pdf بر روی عنوان انگلیسی مقاله کلیک نمایید.
• برای خرید و دانلود ترجمه فارسی آماده با فرمت ورد، روی عنوان فارسی مقاله کلیک کنید.