دانلود ترجمه مقاله تشخیص آلل های HLA اجدادی تائیدی جمعیت ژاپنی – نشریه PLOS

• فهرست مطالب:

چکیده
مقدمه
مواد وروش ها
شرکت کننده ها
HLA typing
آنالیز های آماری
نتایج
تفاوت ژنتیکی بین جمعیت های ده منطقه
آنالیز اجزای مرکزی برای شناسایی آلل های اجدادی
مدل هاپلوتایپی
آنالیز عدم تعادل گامتی و جست و جوی اجداد مشترک
بحث و گفت و گو

• بخشی از ترجمه:

بحث و گفت و گو
طبقه بندی جمعیت علت احتمالی بروز نتایج مثب کاذب در مطالعات پیوستگی ژنتیک می باشد. ما در این پژوهش نشان دادیم، طبقه بندی ویژ ه ای در جمعیت ژاپن علی الخصوص بین Okinawa و دیگر جزایر اصلی وجود دارد. بنابراین، لازمست در مطالعات ساختار های فرعی ژنتیکی به جمعیت های مختلف توجه ویژه ای داشت. جمعیت به دو گروه ( منطقه اصلی و Okinawa) مطالعات مورد-شاهدی (case-control) تقسیم بندی شده و پس از آن مطالعه متاآنالیزی بر نتایج این دو گروه انجام شده است. هرچند تفاوت های ناچیزی در فراوانی آلل های HLA و هاپلوتایپ ها بین مناطق اصلی ژاپن نیز وجود دارد. به منظور بررسی ساختار های فرعی ژنتیکی بین جزایر اصلی، PCA دیگری پس از حذف Okinawa از پایگاه داده انجام شد (تصویر S2). در اولین مولفه، دو انتهای آن نشانگر جمعیت های Shikoku و hokuriku هستند. اولین مولفه PCA، شامل تمام جمعیت ژاپنی می شود (تصویر ۲A)، دو انتهای Okinawa, Hokuriku, Shikoku با Okinawa قرابت دارد. از این نتایج می توان اینگونه استنباط کرد که جمعیت مناطق اصلی در پلات PCA(تصویر S2)، مشابه به اولین مولفه تصویر ۲A است، در نتیجه لازمست جمعیت منطقه اصلی نیز طبقه بندی شود. لازمست جهت بررسی تفاوت ها و تمایزات بین گروه های جزایر اصلی مطالعه عظیمی انجام شود.

• بخشی از مقاله انگلیسی:

Discussion

Population stratification is a potential cause of the inflation of false positive findings in genetic association studies. We demonstrated that there was a substantial level of population stratification in Japanese population, especially between Okinawa and other mainland groups. Therefore, careful consideration on population substructure is needed in genetic association studies in Japanese population. It is recommended that case-control study is performed by stratifying into two groups (mainland and Okinawa), followed by meta-analysis integrating the results from the two groups [17,45–۴۷]. To a lesser extent, there were differences in frequencies of HLA alleles and haplotypes among mainland groups. In order to examine extent of population substructure among mainland groups, we performed another PCA after removing Okinawa from the dataset (Figure S2). In the first component, both ends of the first component were Shikoku and Hokuriku. In the first component of the PCA including all the Japanese populations (Figure 2A), both ends were Okinawa and Hokuriku, and Shikoku was closest to Okinawa. This result shows the localization of mainland populations in the PCA plot (Figure S2) is similar to that in Figure 2A regarding the first component, implying that the population stratification exists among mainland populations. A large scale study is needed to corroborate the differentiations among mainland groups.

دانلود رایگان مقاله انگلیسی

خرید ترجمه فارسی مقاله