دانلود ترجمه مقاله نقشه برداری دامنه های DNA و اتصال روی در ASR1 یک پروتئین خاص گیاهی – الزویر ۲۰۰۶

مشخصات مقاله انگلیسی (PDF)
سال انتشار	۲۰۰۶
تعداد صفحات مقاله انگلیسی	۸صفحه با فرمت pdf
رشته های مرتبط با این مقاله	زیست شناسی
گرایش های مرتبط با این مقاله	ژنتیک، علوم گیاهی، میکروبیولوژی و علوم سلولی و مولکولی
مجله	بیو شیمی – Biochimie
دانشگاه	موسسات علوم کاربردی، دانشگاه بن گوریون، اسرائیل
کلمات کلیدی	تنش غیرزنده. اتصال DNA. تنش-نمک. تنش-آب. اتصال-روی. اتصال DNA وابسته به روی
شناسه شاپا یا ISSN	ISSN ۰۳۰۰-۹۰۸۴
رفرنس	دارد ✓
لینک مقاله در سایت مرجع	لینک این مقاله در نشریه Elsevier
نشریه الزویر

• فهرست مطالب:

چکیده

۱٫ مقدمه

۲٫ مواد و روش ها

۲٫ ۱٫ مواد گیاهی و استخراج پروتئین های برگ

۲٫۲٫ ساخت جهش یافته های حذف

۲٫۳٫ بروز و خالص سازی ASR1 و پروتئین های مشتق شده

۲٫۴٫ آبکافت اسید ملایم

۲٫۵٫ اتصال DNA

۲٫ ۶٫ حركت‌ ذرات‌ معلق‌ پروتئین بوسيله‌ نيروي‌ برق‌

۲٫۷٫ وسترن بلات (یکی از تکنیک ها و روش های تشخیص پروتئین ها)

۲٫۸٫ تجزیه پروتئین ها

۲٫۹٫ MALDI-TOF-MS

۳٫ نتایج

۳٫ ۱٫ نگاشت حوزه فعالیت اتصال DNA از ASR1

۳٫۲٫ اتصال Zn2+ توسط ASR1

۳٫۳٫ اتصال-روی باعث تغییرات انطباقی می شود

۳٫ ۴٫ نگاشت حوزه اتصال-روی

۴٫ بررسی

• بخشی از ترجمه:

۴٫ بررسی ASR1 دارای فعالیت اتصال DNA وابسته به روی بود [۱۶]. باقی مانده های اسید آمینه و یا حوزه های پروتئینی گنجانده شده در اتصال DNA، و یا روی برای آن موضوع نمی تواند از یک تجزیه و تحلیل توالی یا همولوژی های ساختاری امکان پذیر استنتاج شود. اتصال DNA به باقی مانده های ترمینال -کربوکسی ۶۱-۱۱۵ بر اساس محصولات به دست آمده توسط آبکافت اسید ملایم نگاشت برداری شد (شکل ۱). علاوه بر این، فعالیت اتصال DNA از پایانه-کربوکسی ASR1 وابسته به روی بود که نشان می دهد که این حوزه شامل یک محل (های) اتصال-روی می شود. از سوی دیگر، محل های اتصال-روی با میل زیاد تشخیص داده شده توسط تجزیه و تحلیل های MALDITOF-MS در حوزه ترمینال-آمینو می باشد. با استفاده از یک سری از جهش های کوتاه شدن، باقی مانده های اسید آمینه موجود در اتصال DNA بیشتر نگاشت شد (شکل ۲). به نظر نمی رسد که باقی مانده های ۱۰۵-۱۱۵ در اتصال-DNA وابسته به روی درگیر هستند، همانطور که حذف آنها روی اتصال DNA تاثیر نمی گذارد. حذف باقی مانده های ۹۶-۱۱۵ و ۸۷-۱۱۵ به کاهش عمیق (~ ۷۵٪) در فعالیت اتصال DNA منجر شد که البته هنوز وابسته به روی است. با کمال تعجب، حذف بیشتر پروتئین ASR1 (ASR1Δ۷۷-۱۱۵ و ASR1Δ۶۹-۱۱۵) به بهبود فعالیت اتصال DNA (حدود نیمی که از ASR1 نوع وحشی) منجر شد. ما پیشنهاد می کنیم که این مشاهده ظاهرا متناقض از AAVGAGGFAF توالی آبگریز در ۷۷-۸۶ باقی مانده های اسید آمینه از ASR1Δ۹۶-۱۱۵ کوتاه شده و پروتئین های ASR1Δ۸۷-۱۱۵ حاصل می شود. این باقیمانده ها ممکن است با یکی دیگر از پچ های آبگریز از پروتئین های کوتاه شده تعامل داشته باشند که احتمالا مانع اتصال DNA می شود. حذف این باقی مانده ها به افزایش میل اتصال DNA برای ASR1Δ۷۷-۱۱۵ محصول بیشتر کوتاه و ASR1Δ۶۹-۱۱۵ منجر می شود.

• بخشی از مقاله انگلیسی:

۴٫ Discussion

ASR1 possesses a zinc-dependent DNA-binding activity [16]. The amino acid residues or protein domains involved in the binding of DNA, or zinc for that matter, could not be deduced from either a sequence analysis or possible structural homologies. DNA-binding was mapped to the carboxy-terminal residues 61–۱۱۵ based on products obtained by mild acid hydrolysis (Fig. 1). Furthermore, the DNA-binding activity of the ASR1 carboxy-terminus was zinc dependent, suggesting that this domain contains a zinc-binding site(s). On the other hand, the high affinity zinc-binding sites detected by MALDITOF-MS analyses are at the amino-terminal domain. Using a series of truncation mutants, the amino acid residues involved in DNA-binding were mapped further (Fig. 2). Residues 105– ۱۱۵ do not appear to be involved in zinc-dependent DNAbinding, as their omission does not affect DNA-binding. Deletion of residues 96–۱۱۵ and 87–۱۱۵ resulted in a profound decrease (~75%) in DNA-binding activity, albeit still being zinc-dependent. Surprisingly, further deletions of the ASR1 protein (ASR1Δ۷۷–۱۱۵ and ASR1Δ۶۹–۱۱۵) resulted in improved DNA-binding activity (about half that of the wild type ASR1). We propose that this apparently paradoxical observation results from the hydrophobic sequence AAVGAGGFAF at amino acid residues 77–۸۶ of the truncated ASR1Δ۹۶–۱۱۵ and ASR1Δ۸۷–۱۱۵ proteins. These residues may interact with another hydrophobic patch of the truncated proteins, possibly hindering DNA-binding. Removal of these residues results in an increased DNA-binding affinity for the further truncated products ASR1Δ۷۷–۱۱۵ and ASR1Δ۶۹–۱۱۵٫

دانلود رایگان مقاله انگلیسی

خرید ترجمه فارسی مقاله با فرمت ورد