دانلود ترجمه مقاله چگونگی رخ دادن مغایرت رونویسی-تکثیر (NATURE ۲۰۱۶) (ترجمه ویژه – طلایی ⭐️⭐️⭐️)

مغایرت رونویسی-تکثیر: چگونه رخ می دهد و چگونه حل می شوند؟

Transcription–replication conflicts: how they occur and how they are resolved

چکیده

تعمیر همراه با رونویسی

DNA غیر B

چگونه برخورد رخ می دهد؟

عناصر CIS تاثیرگذار بر برخوردها

ابرمارپیچ شدن

سرسنجاقی

DNA سه گانه

چهاررشته ای G

Combing DNA

کانون γH2AX

ابرمارپیچ شدن DNA

ساختارهای DNA غیر B و هیبریدهای RNA-DNA

جزایر CpG

مکانیسم هایی برای جلوگیری از تعارض ها

تشکیلات رونویسی RNA پلیمراز

بسته 1 | محل های شکننده به عنوان نقاط داغ برخوردهای همانندسازی- رونویسی

Break-sec

برومودزوکسی یوریدین

خانواده RecQ

موانع دوشاخه ی همانندسازی

DNA هلیکاز RECQL5

تغییر وضع کروماتین

تعارضات و پاسخ آسیب DNA

جلوگیری از تعارض همانندسازی-رونویسی با DDR

جعبه 2 | انکوژن ها و برخوردهای همانندسازی- رونویسی

حل تعارض توسط BRCA و پروتئین های کم خونی فانکونی

نتیجه گیری و دیدگاه ها

چکیده

وقوع مکرر رونویسی و تکثیر DNA در سلول ها منجر به برخوردهای بسیار و در نتیجه تعارض بین تشکیلات رونویسی و تکثیر می شود. این تعارض ها یک منبع اصلی برای عدم ثبات ژنوم هستند که مشخصه سلول های سرطانی است. چگونگی پیشرفت تشکیلات تکثیر در یک مولکول DNA که توسط RNA پلیمراز اشغال شده است، یک سوال قدیمی است. در اینجا، داده های اخیر مربوط به ارتباط زیستی تعارض تکثیر- رونویسی و عوامل و مکانیسم هایی که در پیشگیری یا حل آن ها، عمدتا در یوکاریوت ها دخیل هستند را بررسی می کنیم. بر اساس این داده ها، دیدگاه فعلی ما در مورد چگونگی ایجاد مانع توسط رونویسی برای تکثیر، از جمله تنش پیچیدگی و ساختارهای DNA غیر B، و فرآیندهای مختلف سلولی تکامل یافته برای حل آن ها ارائه می شود.

نتیجه گیری و دیدگاه ها

ما هنوز درک مولکولی از چگونگی حرکت دوشاخه های رونویسی در مناطق DNA تحت رونویسی وجود ندارد. شواهد جمع آوری شده در دو دهه گذشته نشان می دهد که یک منبع مهم طبیعی از بی ثباتی ژنوم، از تعارضات همانندسازی-رونویسی است. ارتباط زیست پزشکی تعارضات همانندسازی-رونویسی توسط چندین وضعیت مستعد سرطان یا بیماری های انسانی مانند آنمی فانکنی، ataxia‑ ocular apraxia نوع 2 یا اسكلروز جانبی آمیوتروفی نوع 4 تاکید شده است که ناشی از جهش در ژن های درگیر در جلوگیری یا حل این برخوردها هستند. اخیرا شناسایی عوامل و مکانیسم های احتمالی آغاز شده است که می توانند در کاهش تعداد برخوردها یا حل آنها مشارکت داشته باشند تا عواقب منفی آن ها مانند تنش همانندسازی و شکست های DNA را محدود کنند. با این حال، کشف مکانیزم هایی که توسط آنها دوشاخه های همانندسازی، DNA در حال رونویسی را بدون آسیب زدن به یکپارچگی ژنوم همانندسازی می کنند، هنوز نیازمند شناسایی توالی های DNA یا ساختارهای ثانویه یا ویژگی-های خاص کروماتین در نقاط داغ برخورد است.

Abstract

The frequent occurrence of transcription and DNA replication in cells results in many encounters, and thus conflicts, between the transcription and replication machineries. These conflicts constitute a major intrinsic source of genome instability, which is a hallmark of cancer cells. How the replication machinery progresses along a DNA molecule occupied by an RNA polymerase is an old question. Here we review recent data on the biological relevance of transcription–replication conflicts, and the factors and mechanisms that are involved in either preventing or resolving them, mainly in eukaryotes. On the basis of these data, we provide our current view of how transcription can generate obstacles to replication, including torsional stress and non‑B DNA structures, and of the different cellular processes that have evolved to solve them.

Conclusions and perspectives

We do not yet have a molecular understanding of how replication forks traverse DNA regions undergoing tran‑ scription. Evidence accumulated in the past two decades indicates that an important natural source of genome instability stems from transcription–replication conflicts. The biomedical relevance of transcription–replication conflicts is emphasized by several cancer-prone condi‑ tions or human diseases, such as Fanconi anaemia, ataxia-ocular apraxia type 2 or amyotrophic lateral sclerosis type 4, which are caused by mutations in genes that are involved in preventing or solving such conflicts. We have recently started to identify factors and putative mech‑ anisms that may contribute to either diminishing the fre‑ quency of collisions or resolving them in a way that limits their negative consequences, such as replication stress and DNA breaks. However, to decipher the mechanisms by which replication forks replicate DNA undergoing transcription without compromising genome integrity, we still need to identify DNA sequences or secondary structures, or specific chromatin features at collision hot spots.

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

مغایرت رونویسی-تکثیر: چگونه رخ می دهد و چگونه حل می شوند؟

Transcription–replication conflicts: how they occur and how they are resolved