دانلود ترجمه مقاله توصیف تشریح شیفت دانسیته الکترونی تعاملات درون مولکولی غیرپیوندی – الزویر 2012

تشریح شیفت دانسیته الکترونی تعاملات درون مولکولی غیرپیوندی

Electron density shift description of non-bonding intramolecular interactions

چکیده

1 – مقدمه

2 – جزئیات محاسبه

3 – متدولوژی

4 – نتایج و بحث

4 -1 برهمکنشهای بین مولکولی

4 -2 برهمکنشهای درون مولکولی

5 – نتیجه گیری

چکیده

برای مطالعه شیفت دانسیته الکترونی برهمکنشهای غیر پیوندی ، راهکار و متدولوژی جدیدی تعریف میشود. این متدولوژی در یک ترکیب کمپلکس با پیوند بین مولکولی، مورد آزمایش قرار گرفته است و با شیفت دانسیته الکترونی محاسبه شده بصورت اختلاف شیفت دانسیته بین کمپلکس و منومرهای واحد، مقایسه شده است. در این مقاله فرایند تفکیک مولکولی به اجزای سازنده و کاربرد این فرایند در پیوندهای هیدروژنی، برهمکنشهای کالکوژن-کالکوژن، برهمکنشهای نیتروژن-بور، برهمکنشهای دی هیدروژن و برهمکنشهای نیتروژن-سیلیسیم شرح داده شده اند. انتخاب دقیقی از شمای تفکیک مولکولی برای توصیف دقیق شیفت دانسیته الکترونی در برهمکنشهای درون مولکولی ضروری میباشد. به همین دلیل درجات مختلف تفکیک مولکولی با وجود مشکلات و محدودیتهایی که متدولوژی مورد نظر دارد، مطالعه و بررسی میشوند. این متدولوژی ابزار جدیدی است که توصیف کیفی خوبی از شیفت دانسیته الکترونی ارائه میدهد و در آن ناحیه برهمکنش کننده بین دو یا چند جزء برهمکنش کننده ، در هردو نوع برهمکنش درون مولکولی و بین مولکولی، بطور متعارف هزینه محاسباتی پایینی دارد.

5- نتیجه گیری
در این مقاله متدولوژی جدیدی برای مطالعه EDS (شیفت دانسیته الکترونی) در برهمکنشهای درون مولکولی بر مبنای طرح تفکیک مولکولی مطرح شده است. این متدولوژی در یک دیمر با پیوند هیدروژنی یا یک پیوند دی هیدروژنی درون مولکولی مورد آزمایش قرار گرفته و در آن EDS بصورت اختلاف EDS کمپلکس و منومرهای سازنده محاسبه گردیده است. شاخصی بنام شاخص شباهت Hodgkin برای کمّی سازی شباهت بین یک EDS واقعی و EDSهایی که از طریق متدولوژی مورد نظر محاسبه شده اند، بکار رفته است. EDS درون مولکولی برای تعدادی از برهمکنشهای درون مولکولی مثل پیوندهای هیدروزنی، برهمکنشهای کالکوژن-کالکوژن ، N…Br، B…N ، دی هیدروژن ، N…Si و نیز پیوندهای هالوژن-هالوژن و هیدروژن-هیدروژن با ارائه توصیفی کیفی در همه موارد، محاسبه شده اند. براساس این مقاله، قوانین زیر برای طرح تفکیک پیشنهاد میشوند: الف) انتخاب بزرگترین درجه تفکیک ممکن. ب) عدم انتخاب مرتبه تفکیک در جزء HH^n که با جزء مولکولی H2 مطابقت دارد. ج) تنها تفکیکهایی که منجر به شکستن پیوند یگانه میشوند مجاز هستند.

Abstract

A new methodology is described for the study of the electron density shift in intramolecular interactions. The methodology has been tested in an intermolecular complex and compared to the electron density shift obtained as the difference between the complex and the isolated monomers. The molecular fragmentation procedures and its application to hydrogen bonds, chalcogen–chalcogen interactions, nitrogen–boron interactions, dihydrogen interactions and silicon–nitrogen interactions are described. A careful selection of the fragmentation scheme is necessary in order to describe correctly the electron density shift in the intramolecular interactions. For this reason, different orders of fragmentation have been studied and analyzed pointing out the problems and limitations which are inherent to the methodology. It has been found that this methodology is a new tool which provides a good qualitative description of the electron density shift within the interacting region between two or more contacts, in both inter and intramolecular contacts with a reasonable low computational cost.

5- Conclusions

A new methodology for the study of the EDS in intramolecular interaction based on the molecular fragmentation scheme is described. The methodology has been tested in an intermolecular HB dimer, where the EDS can be obtained as the difference between the complex and the isolated monomer. The Hodgkin similarity index has been used to quantify the similarity between the exact EDS and those obtained by the methodology proposed here. The intramolecular EDS have been calculated for a variety of intramolecular interactions: hydrogen bonds, chalcogen–chalcogen, NBr, BN, dihydrogen and SiN interactions, and also repulsive halogenAhalogen and hydrogen–hydrogen contacts, providing a qualitative description in all the cases. Based on this study the following rules for the fragmentation scheme are recommended: (1) select the highest order of fragmentation possible, (2) do not chose that order in which the HHn fragment corresponds to the H2 molecule, (3) only fragmentations which involve the rupture of single bond are allowed.

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

تشریح شیفت دانسیته الکترونی تعاملات درون مولکولی غیرپیوندی

Electron density shift description of non-bonding intramolecular interactions