دانلود ترجمه مقاله بررسی دی ان ای و ژنوم

• بخشی از ترجمه:

چکیده
اندازه ژنوم ها، در صورتی که با ژنوم های دیگر ترکیب گردد، یا DNA هایی را از طریق یک ویروس یا مکانیسم های دیگر انتقال افقی گرداوری کند، ممکن است به سرعت تغییر کند. دسترسی به DNA جدید به معنی دسترسی به ژن جدید می باشد اما ژنوم ها دارای محدودیت اندازه می باشند. چرا؟ هر چرخه رونوشت، برای ژنوم های بزرگتر هزینه ای را در بر دارد و بنابراین ژنوم ها می بایست تعادلی را برای مقدار رونوشت DNA با داشتن ژن هایی که دارای مزایای گزینشی تحت شرایط خاص می باشند، ایجاد کنند. برعکس از دست دادن DNA و ژن ها می تواند مفید باشد اگر سلول های مربوطه شکاف های جدید ( همانند گونه های دگیر) را پر کنند. اگر ژن ها، دیگر مفید نباشند، DNA ها ار بین رفته و ژنوم های کارآمدتر مزایای گزینشی را خواهند داشت. از آنچه که تا به حال بیان کرده ایم اندازه ژنوم ها برای گروهی از گونه ها در یک اندازه نسبتا محدودی قرار می گیرند. برای نمونه بخش های K وo بدن فرد، DNA جدیدی را کسب می کنند اما باکتری های مربوط به روده دارای ژنوم هایی در محدوده ۴ و ۵ MB می باشند. زمانی که آن ها DNA جدیدی را کسب می کنند، سلول ها به تعادل حیاتی ژتوم ، با اندازه بهینه شده و ژن ها شمارش شده بر می گردند.
شما ممکن است این موضوع را در ذهن داشته باشید که ٢٠٠ توالی ژنوم کافی بوده و نیاز به توالی بیشتر نمی باشد اما در تعداد ژنوم های نسبی، قدرتی وجود دارد. تصور کنید که تمام عمر خود را در یک غار زندگی کرده اید و روزی که بیرون آمدید یک پرنده امربکای شمالی آبی رنگ و یک زاغ آبی رنگ را دیده اید، بر این اساس شما ممکن است تصور کنید که تمام پرندگان آبی رنگ هستند. در روزهای بعد شما یک سهره قرمز رنگ و یک قناری زردرنگی را می بینید و شما ممکن است به این نتیجه گیری برسید که تمام پرندگان از همان ابتدای وجودشان دارای رنگ های خاصی می باشند. استفاده از نمونه های کمتر ممکن است شما را منتهی به نتیجه گیری اشتباهی بکند. زمانی که شما مرغ مگس خوار، شترمرغ و پنگوئن را مشاهده می کنید این موارد باعث تعجب شما می شود. زمانی که ما در ارتباط با تنوع پرندگان مطالعات بیشتری را انجام می دهیم، چیزهای بیشتری نیز در ارتباط با آن ها یاد می گیریم. و زمانی که ما نمونه های بیشتری در دست داریم، چیزهای بیشتری نیز در ارتباط با ژنوم ها یاد می گیریم. به هر حال منابع محدود بوده و بنابراین می بایست به طور آگاهانه ای انتخاب کنیم که چه ژنومی را می خواهیم انتخاب کنیم تا بتوانیم توانایی های خود را در ارتباط با فرا گرفن آن ها افزایش دهیم.

• بخشی از مقاله انگلیسی:

abstract

The size of a genome may change very rapidly if it fuses with another genome, or accumulates some DNA via a virus, or some other mechanism of horizontal transfer. Acquiring new DNA means acquiring new genes, but genomes do have size limits. Why? Every round of replication extracts a cost for the larger genome, and therefore genomes must balance the expense of replicating redundant DNA with the benefit of having genes that provide a selective advantage only under rare circumstances. Conversely, losing DNA and genes could be advantageous if the cell evolves to fill a new niche, such as inside another species. If genes are no longer advantageous, the DNA can be lost and the more efficient genome provides a selective advantage. From what we can tell so far, genome sizes tend to stay within a fairly narrow size range for a given group of species. For example, Kand O-islands are newly acquired DNA, but all gut bacteria tend to have genomes in the 4 to 5 Mb range. As they acquire new DNA, cells tend to return to a genome home-ostasis with an optimal size and gene count. You might think that 200 sequenced genomes is enough and that we don’t need to sequence more, but there is power in numbers for comparative genomics. Consider the analogy of living in a cave all your life and coming out one day and seeing a bluebird and a blue jay. Based on this sampling, you might conclude that all birds are blue. Later in the day, you see a red cardinal and a yellow canary, which leads you to conclude diat all birds must be primary colors. Using a small sample size leads to inaccurate conclusions. Imagine your surprise when you see a hummingbird, an ostrich, and a penguin. Just as we learn more about birds by studying their diversity, we learn more about genomes when we have a larger sample size. However, resources are limited so we must choose wisely which genomes we sequence to maximize our ability to learn from them (see Section 2.1). DISCOVERY QUESTIONS 5. Copy and paste the E. coli K-12 20 kb fragment of DNA and perform a GC skew analysis on the DNA. Can you detect the origin of replication? Go to the M. genitalium genome picture (Figure 2.15) and use gene orientation to identify the origin of replication. Then find one gene not pointing in the “right” direction and see if you can determine if it is in the Database of Essential Genes (DEC).

دانلود رایگان مقاله انگلیسی

خرید ترجمه فارسی مقاله