این مقاله انگلیسی ISI در 8 صفحه در سال 2013 منتشر شده و ترجمه آن 11 صفحه میباشد. کیفیت ترجمه این مقاله ویژه – طلایی ⭐️⭐️⭐️ بوده و به صورت کامل ترجمه شده است.

• فهرست مطالب:

چکیده

مقدمه

مواد و روش ها

ماده گیاهی

استخراج DNA و تکثیر PCR

تحلیل داده ها

نتایج و بحث

پروفایل های RAPD-DNA

تحلیل داده ها

• بخشی از ترجمه:

تحلیل داده ها

تجزیه و تحلیل داده ها بر اساس نتایج گرفته شده از عکس های ژل آگارز برای هر آغازگر بود. فقط باندهای مرئی برای تجزیه و تحلیل داده ها مورد بررسی قرار گرفتند. آنالیزهای فیلوژنتیک و فنتیک در یک ماتریس داده شامل ویژگی های با عدد ‘1’ برای وجود باند و ‘0’ برای عدم وجود باند روی عکس های ژل انجام شد. برای تجزیه و تحلیل داده های RAPD-DNA، در تمام هفت آغازگر 84 ویژگی/باند محقق شده بود. آغازگرها حداکثر دوازده صفت را تولید کردند. ماتریس داده ها می تواند بر اساس درخواست نویسنده ارائه شود. ماتریس داده ها برای استفاده در نرم افزار PAUP*، نسخه 4.0blO به فرمت #NEXUS تبدیل شدند.

در طول تجزیه و تحلیل، از parsimony و فاصله ژنتیکی (حداقل تکامل) استفاده شد. در تجزیه و تحلیل parsimony از الگوریتم Branch-and-Bound استفاده شد و 45 ویژگی ثابت از 84 ویژگی، 20 ویژگی متغیر بدون اطلاعات و 19 ویژگی متغیر حاوی اطلاعات نشان داده شد. تمام ویژگی ها با یک اندازه مشخص وزن-دهی شده و 10000 درخت در طول تجزیه و تحلیل در حافظه نگهداری شدند، در حالی که تمام توپولوژی های درخت بدون محدودیت مورد بررسی قرار گرفتند. در تجزیه و تحلیل 8 درخت parsimonious با 65 مرحله وجود داشت. شکل 2 درخت شماره 1 از 8 درخت parsimonious را نشان می دهد. این 8 درخت به یک اندازه parsimonious بوده و درخت شماره یک، به دلیل شباهت آن به درخت neighbor joining (NJ)  از بین آن ها انتخاب شد (شکل 2 و 3). به منظور ارزیابی آماری در شاخه های فردی، تجزیه و تحلیل بوت استرپ (Felsenstein 1985) انجام شد و شاخه های با بوت استرپ بالاتر یا پایین تر از 50 درصد زیر شاخه های شکل 2 نشان داده شده است.

• بخشی از مقاله انگلیسی:

DATA ANALYSIS

Analysis of data was based on the results taken from the agarose gel photos for each primer. Only visible bands were evaluated for data analysis. Phylogenetic and phenetic analyses were performed on a data matrix comprising characters scored as ‘1’ for presence of the band and ‘0’ for absence of the band on the gel photos. For the analysis of RAPD-DNA data, in all seven primers with 84 characters/ bands were attained. Primers generated maximum twelve characters. Data matrix can be presented upon request by the corresponding author. Data matrix was converted to #NEXUS format for the application in PAUP* software, Version 4.0b10.

During the analysis, parsimony and genetic distance (minimum evolution) criteria were used. Parsimony analysis used Branch-and-Bound algorithm and revealed 45 constant characters out of 84 characters, 20 variable parsimony-uninformative characters and 19 variable parsimony-informative characters. All characters were weighted equally and 10000 trees were kept in memory through the analysis, while all tree topologies were evaluated without constraints. Analysis yielded 8 most parsimonious trees with 65 steps. Figure 2 shows tree number 1 of 8 most parsimonious trees. These 8 trees were equally most parsimonious and the tree number one was chosen among them due to its similarity to neighbor joining (NJ) tree (cf. Figures 2 and 3). In order to assess the statistical supports on individual branches, a Bootstrap analysis (Felsenstein 1985) was performed and branches getting Bootstrap supports higher or lower than 50% were shown in numbers below branches on Figure 2.

دانلود رایگان مقاله انگلیسی

خرید ترجمه فارسی مقاله با فرمت ورد

نوشته دانلود ترجمه مقاله تحلیل تبارزایش مولکولی ارقام زیتون Olea europaea L. subsp. europaea اولین بار در ترجمه فا پدیدار شد.

• بخشی از ترجمه:

چکیده
نشانگرهای مولکولی(DArT,SSR,SNP) و ویژگی های برزشناختی در بزرگترین مجموعه جرم پلاسم زیتون دنیا (انجمن پژوهش و آموزش کشاورزی و شیلات، مرکز آلامدا دل آبیسپو، کوردوبا در اسپانیا) مورد استفاده قرار گرفته است تا الگوهای تنوع ژنتیکی و ساختار اصلی ژنتیکی را بین ٣۶١ شماره دسترسی زیتون بررسی کند. بعلاوه، داده های نشانگر برای ساخت گروهی از مجموعه های هسته با دو الگوریتم متفاوت (MSTRAT و پاورکور) برپایه استراتژی بیشینه سازی استفاده شدند. نتایج ما تصدیق می کنند که مجموعه جرم پلاسم، منبعی سودمند از مواد گوناگون ژنتیکی است. هم چنین دریافتیم که خاستگاه جغرافیایی، عاملی مهم است که در زیتون تنوع ژنتیکی می سازد. زیرگروه های ١٨، ٢٧، ٣۶، ۴۵و۶٨ زیتون که به ترتیب %۵، %٧.۵، %١٠، %١٢.۵ و %١٩را از کل مجموعه جرم پلاسم نشان می دادند، براساس اطلاعات حاصل از همه گروه داده ها به همراه هر نوع نشانگر منفردا در نظر گرفته شده انتخاب شدند. طبق نتایج ما، مجموعه های هسته که بین %١٠ و %١٩ از کل اندازه مجموعه را نشان می دهند می توانند مناسب ترین مجموعه ها در حفظ قسمت عمده تنوع ژنتیکی یافت شده در این مجموعه در نظر گرفته شوند. به سبب کارایی بالای آن در جذب همه وضعیت های الل/ویژگی های یافت شده درکل مجموعه، اندازه هسته دسترسی های شماره ۶٨ می تواند حائز اهمیت خاصی برای کاربردهای حفظ ژنتیکی در زیتون باشد. میانگین بالای فاصله ژنتیکی و تنوع و نمایندگی تقریبا برابر دسترسی ها از مناطق جغرافیایی متفاوت بیان می کنند که اندازه هسته از دسترسی های ٣۶ می تواند مجموعه کارآمد برای پرورش دهندگان زیتون باشد.
کلیدواژه ها: جرم پلاسم زیتون، تنوع ژنتیکی، گروه های هسته، نشانگرهای مولکولی،پرورش زیتون
مقدمه:
در بیشتر کشت ها ، تاکید زیادی بر گردآوری و حفظ منابع ژنتیکی شده است که منجر به استقرار بانک های جرم پلاسم آفسایت در سرتاسر جهان شده است. اهداف بنیادین یک بانک جرم پلاسم حصول، حفظ، اثبات ، ارزیابی و ایجاد تنوع ژنتیکی گیاه نماینده قابل حصول از کشت مورد نظر است. اگرچه ، علی رغم توسعه قابل ملاحظه به دست آمده در دهه های اخیر جهت جلوگیری از زوال ژنتیکی بسیاری از گونه های کشت، هنوز فاصله زیادی بین تنوع جرم پلاسم در دسترس گردآوری شده و استفاده موثر آن وجود دارد ( ون هینتوم و همکاران ٢٠٠٠)

• بخشی از مقاله انگلیسی:

Abstract

Molecular markers (SSR, SNP and DArT) and agronomical traits have been used in the world’s largest olive (Olea europaea L.) germplasm collection (IFAPA, Centre Alameda del Obispo, Cordoba, Spain) to study the patterns of genetic diversity and underlying genetic structure among 361 olive accessions. In addition the marker data were used to construct a set of core collections by means of two different algorithms (MSTRAT and PowerCore) based on M (maximization) strategy. Our results confirm that the germplasm collection is a useful source of genetically diverse material. We also found that geographical origin is an important factor structuring genetic diversity in olive. Subsets of 18, 27, 36, 45 and 68 olive accessions, representing respectively 5%, 7.5%, 10%, 12.5% and 19% of the whole germplasm collection, were selected based on the information obtained by all the data set as well as each marker type considered individually. According to our results, the core collections that represent between 19% and 10% of the total collection size could be considered as optimal to retain the bulk of the genetic diversity found in this collection. Due to its high efficiency at capturing all the alleles/traits states found in the whole collection, the core size of 68 accessions could be of special interest for genetic conservation applications in olive. The high average genetic distance and diversity and the almost equal representation of accessions from different geographical regions indicate that the core size of 36 accessions, could be the working collection for olive breeders.

دانلود رایگان مقاله انگلیسی

خرید ترجمه فارسی مقاله

نوشته دانلود ترجمه مقاله پرورش هسته زیتون بر اساس نشانگرهای مولکولی و صفات زراعی – نشریه اسپرینگر اولین بار در ترجمه فا پدیدار شد.

• بخشی از ترجمه:

چکیده
این مقاله تکنولوژی تنوع آرایه ای را در بررسی زیتون نوع olea europaea را مورد بررسی قرار می دهد.دو گونه ژنتیکی pstl/taql و ترکیبات آنها بررسی شده و تفاوت های ژنتیکی در بانک پلاسمای ژنی نگه داری می شود world olive germplasm bank (wogb) این تحقیقات بر پایه DNA و٨٩ گونه متفاوت زیتون است .روش دوم تحقیق بر اساس DNA والدین گیاه است .picual وarbequina به ترتیب ژن های گیاه مادری و پدری هستند که از طریق جدا کردن نشانه های ژنتیکی تفاوت های آنها قابل رسم می باشند .این نقشه یک بستر کاری برای دنبال کردن توالی نژادی زیتون و اجرای پروژه oleagen خواهد شد .این پروژه دارای نتیج قابل استناد و هزینه کمی خواهد بود و مورد توجه محقققان است .
مقدمه:
درخت زیتون یا همان Olea europaea یکی از قدیمی ترین درختان حوزه مدیترانه است که اهمیت اقتصادی بالایی دارد.این گیاه در حدود ١٢٠٠ مشخصه بارز دارد که مهمترین آنها اینست که تفاوت ژنی این گیاه و خواص منحصر به فرد هر گونه ،بسیار گوناگون است .این تفاوت ها از روش های ملکولی از جمله rapds شناسایی می شوند و یا روش هایی مانند AFLP,SCAR,ISSR,SNP ،علی رقم تمامی تحقیقات انجام شده هنوز هم کمبود اطلاعاتی در بسیاری جنبه های مربوطه وجود دارد به طور مثال کنترل ژنتیکی خاص برای به وجود آوردن ژن های مورد نظر در گیاه و همچنین هنوز QTL موجود در گیاه ناشناخته مانده است.
اصلی ترین محدودیت در مسیر تحقیقات مربوط به QTL زمان مورد نیاز جهت رشد و بالغ شدن گیاه تا میوه دادن و به ثمر رسیدن محصول است .اگر روش های جدید این عدم تعادل را بهبود و فرایند حاصل شدن میوه رسیده را سرعت بخشند احتمال برطرف شدن کمبود اطلاعات هست.یکی از روش های سرعت بخش Chiquitita نام دارد.اگرچه فعالیت های متوالی پروژه oleagen و همچنین مطالعات ژنتیکی مربوط به QTL و روش LD هم نقش عمده در تولید اطلاعات معتبر و کم هزینه ،دارند.

• بخشی از مقاله انگلیسی:

abstract

The present study reports the setting up of Diversity Arrays Technology (DArT) markers in olive (Olea europaea L.). Two genomic representations were generated using the PstI/TaqI combination. A first one was aimed to cover the variability available at the World Olive Germplasm Bank (WOGB) and it was based on DNA from 87 olive cultivars carefully selected from the WOGB to represent the olive variability. The second one was obtained from DNA of the parents of a mapping population, ‘Picual’ and ‘Arbequina’, and was used to increase the number of markers segregating within them. A total of 2031 and 1630 markers were used for diversity and mapping analyses, respectively to test the utility of DArT markers in olive. A set of 62 cultivars was genotyped with olive-specific DArT markers. A dendrogram was constructed confirming the relationships among olive cultivars reported in previous works. Besides, DArT markers permitted the unambiguous discrimination of all 62 genotypes confirming thus their utility for identification studies, an important issue for management of germplasm collections. DArT markers also allowed the construction of a genetic map of olive using the population derived from the cross ‘Picual’ × ‘Arbequina’ and the pseudo-testcross mapping strategy. This map will be used as a framework map to add new markers derived from olive sequencing originating from the project OLEAGEN. In conclusion, olive-specific DArT markers will enhance identification and genetic studies in olive given their high throughput and low cost per data.

دانلود رایگان مقاله انگلیسی

خرید ترجمه فارسی مقاله

نوشته دانلود ترجمه مقاله فواید نقشه برداری ژنوم و مطالعات تغییر پذیری بر توسعه نشانگر DArT در زیتون – مجله الزویر اولین بار در ترجمه فا پدیدار شد.