دانلود رایگان مقاله انگلیسی + خرید ترجمه فارسی
|
|
عنوان فارسی مقاله: |
تکامل مستقل موازی توانایی بیماریزایی در جنس یرسینیا |
عنوان انگلیسی مقاله: |
Parallel independent evolution of pathogenicity within the genus Yersinia |
|
مشخصات مقاله انگلیسی (PDF) | |
سال انتشار مقاله | 2014 |
تعداد صفحات مقاله انگلیسی | 6صفحه با فرمت pdf |
رشته های مرتبط با این مقاله | زیست شناسی و پزشکی |
گرایش های مرتبط با این مقاله | میکروبیولوژی و باکتری شناسی پزشکی |
مجله مربوطه | مجموعه مقالات آکادمی ملی علوم ایالات متحده آمریکا |
دانشگاه تهیه کننده | گروه تحقیقات پاتوژن، دانشگاه ناتینگهام ترنت، انگلستان |
کلمات کلیدی این مقاله | ساده سازی متابولیک ژنوم، انطباق پاتوژنی، انتروباکتریاسه |
رفرنس | دارد |
لینک مقاله در سایت مرجع | لینک این مقاله در سایت Ncbi |
نشریه Ncbi |
مشخصات و وضعیت ترجمه فارسی این مقاله (Word) | |
تعداد صفحات ترجمه تایپ شده با فرمت ورد با قابلیت ویرایش و فونت 14 B Nazanin | 16صفحه |
ترجمه عناوین تصاویر | ترجمه شده است |
ترجمه متون داخل تصاویر | ترجمه نشده است |
درج تصاویر در فایل ترجمه | درج شده است |
منابع داخل متن | درج نشده است |
- فهرست مطالب:
چکیده
مقدمه
اهمیت
نتایج
تعیین ساختار جنس یرسینیا.
ترسیم توزیع عملکرد عوامل بیماریزا شناخته شده در سراسر جنس
ارزیابی دودمانهای بیماریزا درون یرسینیا انتروکولیتیکا
تکامل یرسینیا انتروکولیتیکا توسط کاهش ظرفیت متابولیکی و از دست دادن عملکرد ژن مشخص میشود
بحث
مواد و روشها
توالییابی و مونتاژ
تجزیه و تحلیل فیلوژنی
جستجو برای ژنها و اپرانهای مربوط به بیماریزایی
ارزیابی میکرواری فنوتیپیک و تجزیه و تحلیل
- بخشی از ترجمه:
ارزیابی میکرواری فنوتیپیک و تجزیه و تحلیل. سویههای باکتریایی بر روی پلیتهای آگار Luria Bertani در 25 درجه سانتیگراد کشت شدند. تلقیح و آمادهسازی مطابق با دستورالعمل شرکت سازنده (Biolog) انجام شد. PM1, 2A (هر دو کربن)، PM3B (نیتروژن) و PM4A (فسفر و گوگرد) انتخاب شدند. L- سیستئین (هومودایمری از L- سیستئین، 12.5 میکرومولار) به عنوان منبع گوگرد احیاکننده به تمام پلیتها اضافه شد و سدیم پیروات (2 مولار) به PM3B و 4A اضافه شد. پلیتها تحت شرایط هوازی به مدت 48 ساعت در 28 درجه سانتیگراد در انکوباتور OmniLog انکوبه شدند و هر 15 دقیقه قرائت شدند. هر آزمایش سه بار تکرار شد. دادهها استخراج شدند و همانطور که قبلا شرح داده شده بود (مجموعه داده S2)، در R با نقاط دادهای که به صورت سیگنال منتقل میشوند تجزیه و تحلیل شدند. هر پلیت توزیع دو بعدی مقادیر سیگنال را نشان داد و توزیع نرمال با دو پیک برای مشخص کردن فعالیت متابولیکی (on و off) شکل مناسب به خود گرفت. امتیازات احتمالی که برای هر نقطه داده محاسبه شده بودند؛ چگونگی توزیع on را برای منبع غذایی نشان داد. احتمالا پیک on 4 برابر بیشتر از پیک off برای آنالیز بیشتر استفاده شد. بسته limma R/Bioconductor برای ارزیابی متابولیسم تفاضلی مورد استفاده قرار گرفت که به موجب آن تمام سویهها با YE8081c مقایسه شدند و از مقادیر p اصلاح شده توسط Benjamini- Hochberg برای تعیین اهمیت آماری تفاوتهای کنترلکننده نرخ کشف اشتباه استفاده شد.
- بخشی از مقاله انگلیسی:
Phenotypic Microarray Experiment and Analysis. Bacterial strains were cultured on Luria Bertani agar plates at 25 °C. Inoculation and preparation was as manufacturer instructions (Biolog). PM1, 2A (both carbon), PM3B (nitrogen), and PM4A (phosphorus, sulfur) were chosen. L-Cystine (homo-dimer of L-cysteine, 12.5 μM) was added as a reduced sulfur source to all plates, and sodium pyruvate (2M) was added to PM3B and 4A. Plates were incubated under aerobic conditions for 48 h at 28 °C in the OmniLog Incubator/Reader, taking readings every 15 min. Three biological replicates were conducted for each experiment. Data were exported and analyzed in R with datapoints being transformed in to signal values, as described previously (Dataset S2) (48). Each plate showed a clear bimodal distribution of signal values, and normal distributions were fitted to the two peaks to characterize metabolic activity (“off” and “on”). Log-odds scores were calculated for each data point showing how likely the “on” distribution was for each nutrient source. A conservative cut-off of four times more likely to be “on” than “off” was used for further analysis. The limma R/Bioconductor package was used to examine differential metabolism whereby all strains were compared with YE8081c, and the Benjamini-Hochberg corrected P values were used to determine statistical significance of differences controlling for a false-discovery rate of 10%.
تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد |
|
دانلود رایگان مقاله انگلیسی + خرید ترجمه فارسی
|
|
عنوان فارسی مقاله: |
تکامل مستقل موازی توانایی بیماریزایی در جنس یرسینیا |
عنوان انگلیسی مقاله: |
Parallel independent evolution of pathogenicity within the genus Yersinia |
|
خرید ترجمه فارسی مقاله با فرمت ورد