این مقاله انگلیسی ISI در نشریه ساینس دایرکت (الزویر) در 8 صفحه در سال 2016 منتشر شده و ترجمه آن 18 صفحه میباشد. کیفیت ترجمه این مقاله ویژه – طلایی ⭐️⭐️⭐️ بوده و به صورت کامل ترجمه شده است.
| دانلود رایگان مقاله انگلیسی + خرید ترجمه فارسی
|
|
| عنوان فارسی مقاله: |
بهینه سازی گردش کار عملکرد و کیفیت سرویس برای کاربرد بیوانفورماتیک در محاسبات با عملکرد بالا |
| عنوان انگلیسی مقاله: |
Workflow optimization of performance and quality of service for bioinformatics application in high performance computing |
|
|
| مشخصات مقاله انگلیسی (PDF) | |
| سال انتشار | 2016 |
| تعداد صفحات مقاله انگلیسی | 8 صفحه با فرمت pdf |
| رشته های مرتبط با این مقاله | زیست شناسی |
| گرایش های مرتبط با این مقاله | بیوانفورماتیک، ژنتیک و علوم سلولی و مولکولی |
| مجله | مجله علوم محاسباتی – Journal of Computational Science |
| دانشگاه | بخش تحقیقات بیومدیکال انفورماتیک، مرکز تحقیقات پزشکی سیدرا، قطر |
| کلمات کلیدی | محاسبات با کارایی بالا، الگوریتم BWA-MEM کیفیت خدمات، تعیین توالی نسل بعدی، مقیاس پذیری، عملکرد نرم افزار و موازی، بهره وری |
| شناسه شاپا یا ISSN | ISSN 1877-7503 |
| رفرنس | دارد |
| لینک مقاله در سایت مرجع | لینک این مقاله در نشریه Elsevier |
| نشریه الزویر |  |
| مشخصات و وضعیت ترجمه فارسی این مقاله (Word) | |
| کیفیت ترجمه | ویژه – طلایی ⭐️⭐️⭐️ |
| تعداد صفحات ترجمه تایپ شده با فرمت ورد با قابلیت ویرایش و فونت 14 B Nazanin | 18 صفحه |
| ترجمه عناوین تصاویر و جداول | ترجمه شده است |
| ترجمه متون داخل تصاویر | ترجمه نشده است |
| ترجمه متون داخل جداول | ترجمه نشده است |
| درج تصاویر در فایل ترجمه | درج شده است |
| درج جداول در فایل ترجمه | درج شده است |
- فهرست مطالب:
1. محاسبات با کارایی بالا برای بیوانفورماتیک ها
2. بررسی مقالات
3. بهینه سازی گردش کار برای برنامه های کاربردی بیوانفورماتیک
نشان گذاری و مفروضات
4. متدلوژی
5. نتایج و بحث
اعتبار سنجی نتایج
6. کار آینده
7. نتیجه گیری
- بخشی از ترجمه:
7. نتیجه گیری
گردش کار بهینه سازی ارائه شده به بهبود عملکرد نرم افزار بیوانفورماتیک کمک می کند و ما این بهبود را در عملکرد، مقیاس پذیری، استفاده از سیستم و بازده موازی با استفاده از محبوب ترین الگوریتم مسیریابی به نام BWAMEM نشان دادیم . ما از داده های ژنوم استاندارد که از Bio-پلنت دانلود شده برای آزمایش هایمان در سیستم High-end HPC با دو ساختار مختلف (اینتل و AMD) تا حدود 64 هسته / گره استفاده کردیم. در نتیجه، بهبود عملکرد به ترتیب بر روی سیستم های اینتل و AMD با مقیاس پذیری ٪ 39و 67٪، تا 66٪ و 200٪، بهبود یافت، و بازده موازی به ترتیب تا 28٪ و39٪ در سیستم High-end HPC بهبود یافت. ما می توانیم کاربرد سیستمی را بر روی ساختار اینتل تا 38٪ بهبود ببخشیم. نتایج بهینه ی به دست آمده با استفاده از استاندارد BamUtil معتبرسازی شدند و ما مشاهده کردیم که دقت نتایج در مقایسه با نتایج مبنا 99.97٪ است. به طورخلاصه، بهترین QoS را می توان با استفاده از بهینه سازی گردش کار سیستماتیک ارائه شده ی ما برای برنامه های کاربردی بیوانفورماتیک بدست آورد.
- بخشی از مقاله انگلیسی:
7. Conclusion
The proposed optimization workflow helps to improve the bioinformatics application performance and we have demonstrated this improvement in performance, scalability, system utilization and parallel efficiency using the most popular BWAMEM alignment algorithm. We used a standard genome data downloaded from Bio-planet for our experiments on high-end HPC systems with two different architectures (Intel and AMD) up to 64 cores/node. As a result, the, performance was improved respectively on Intel and AMD systems by 39% and 67%, scalability extended to 66% and 200%, parallel efficiency improved by 28% and 39% in the high-end HPC systems. We were able to improve the system utilization up to 38% on Intel architecture. The optimized results are validated using the standard BamUtil and we observed 99.97% accurate results compared to baseline results. As a summary, the best QoS can be obtained using our proposed systematic workflow optimization for the bioinformatics applications.
| دانلود رایگان مقاله انگلیسی + خرید ترجمه فارسی
|
|
| عنوان فارسی مقاله: |
بهینه سازی گردش کار عملکرد و کیفیت سرویس برای کاربرد بیوانفورماتیک درمحاسبات با عملکرد بالا |
| عنوان انگلیسی مقاله: |
Workflow optimization of performance and quality of service for bioinformatics application in high performance computing |
|
|
