| دانلود رایگان مقاله انگلیسی + خرید ترجمه فارسی
|
|
| عنوان فارسی مقاله: |
Arlequin (ورژن 3): يك بسته نرم افزاري مجتمع براي آناليز داده هاي علم ژنتيك جمعيت |
| عنوان انگلیسی مقاله: |
Arlequin (version 3.0): An integrated software package for population genetics data analysis |
|
|
| مشخصات مقاله انگلیسی (PDF) | |
| سال انتشار مقاله | 2005 |
| تعداد صفحات مقاله انگلیسی | 4 صفحه با فرمت pdf |
| رشته های مرتبط با این مقاله | زیست شناسی، مهندسی کامپیوتر |
| گرایش های مرتبط با این مقاله | بیو انفورماتیک، ژنتیک، الگوریتم و محاسبات |
| مجله مربوطه | بیوانفورماتیک تکاملی |
| دانشگاه تهیه کننده | آزمایشگاه محاسباتی و مولکولی ژنتیک جمعیت، موسسه جانورشناسی، دانشگاه برن، سوئیس |
| کلمات کلیدی این مقاله | بسته بندی کامپیوتر، ژنتیک جمعیت، تجزیه و تحلیل داده های ژنتیکی، AMOVA، الگوریتم EM، برآورد فاز gametic، گسترش فضایی |
| رفرنس | دارد |
| لینک مقاله در سایت مرجع | لینک این مقاله در سایت Ncbi |
| نشریه | Ncbi |
| مشخصات و وضعیت ترجمه فارسی این مقاله (Word) | |
| تعداد صفحات ترجمه تایپ شده با فرمت ورد با قابلیت ویرایش و فونت 14 B Nazanin | 5 صفحه |
- فهرست مطالب:
چكيده
مقدمه
روش هاي مربوط به داخل جمعيت
روش هاي بين جمعيتي
ويژگي هاي جديد در Arlequin 3
تركيب دو روش جديد براي برآورد فاز گامتي و فراواني هاي هاپلوتيپ:
- بخشی از ترجمه:
ويژگي هاي جديد در Arlequin 3
• نسخه 3 Arlequin رويه هاي هسته اي محاسباتي و رابط در يك برنامه واحد نوشته شده در C براي محيط ويندوز را تركيب مي كند. رابط براي فراهم كردن كارايي بالاتر به صورت كامل مجددا طراحي شده است.
• تركيب دو روش جديد براي برآورد فاز گامتي و فراواني هاي هاپلوتيپ:
الگوريتم ELB يك رويكرد Bayesian كاذب با هدف احياء فاز گامتي ژنوتيپ هاي مولتي لوكوس است و برآورد فراواني هاي هاپلوتيپ نتيجه فرعي اين فرايند است. آپديت هاي فاز برمبناي يك پنجره از مكان هاي ژني مجاور ساخته شده و اندازه پنجره بسته به سطح مكاني عدم تعادل لينكاژي متفاوت است.
الگوريتم زيپ EM كه تعميمي از الگوريتم EM براي برآورد فراواني هاي هاپلوتيپ هست هدف آن برآورد ژنوتيپ هاي مولتي لوكوس فازبندي نشده است. برآورد فازهاي گامتي نتيجه فرعي اين فرايند هستند. اين الگوريتم بوسيله افزودن مكان ژني به صورت تك تك عمل مي كند و به تدريج طول هاپلوتيپ هاي بازسازي شده را توسعه مي دهد.
- بخشی از مقاله انگلیسی:
New features in Arlequin 3
• Version 3 of Arlequin integrates the core computational routines and the interface in a single program written in C++ for the Windows environment. The interface has been entirely redesigned to provide better usability. • Incorporation of two new methods to estimate gametic phase and haplotype frequencies: ◊ The ELB algorithm (Excoffi er et al. 2003) is a pseudo-Bayesian approach aiming at reconstructing the gametic phase of multi-locus genotypes, and the estimation of the haplotype frequencies are a by-product of this process. Phase updates are made on the basis of a window of neighbouring loci, and the window size varies according to the local level of linkage disequilibrium.
| دانلود رایگان مقاله انگلیسی + خرید ترجمه فارسی
|
|
| عنوان فارسی مقاله: |
Arlequin (ورژن 3): يك بسته نرم افزاري مجتمع براي آناليز داده هاي علم ژنتيك جمعيت |
| عنوان انگلیسی مقاله: |
Arlequin (version 3.0): An integrated software package for population genetics data analysis |
|
|