دانلود ترجمه مقاله کاربرد بیوانفورماتیک درمحاسبات با بهینه سازی کیفیت سرویس – الزویر ۲۰۱۶

elsevier1

 

دانلود رایگان مقاله انگلیسی + خرید ترجمه فارسی

 

عنوان فارسی مقاله:

بهینه سازی گردش کار عملکرد و کیفیت سرویس برای کاربرد بیوانفورماتیک در محاسبات با عملکرد بالا

عنوان انگلیسی مقاله:

Workflow optimization of performance and quality of service for bioinformatics application in high performance computing

  • برای دانلود رایگان مقاله انگلیسی با فرمت pdf بر روی عنوان انگلیسی مقاله کلیک نمایید.
  • برای خرید و دانلود ترجمه فارسی آماده با فرمت ورد، روی عنوان فارسی مقاله کلیک کنید.

 

مشخصات مقاله انگلیسی (PDF)
سال انتشار ۲۰۱۶ 
تعداد صفحات مقاله انگلیسی ۸ صفحه با فرمت pdf
رشته های مرتبط با این مقاله زیست شناسی 
گرایش های مرتبط با این مقاله بیوانفورماتیک، ژنتیک و علوم سلولی و مولکولی 
مجله مجله علوم محاسباتی – Journal of Computational Science 
دانشگاه بخش تحقیقات بیومدیکال انفورماتیک، مرکز تحقیقات پزشکی سیدرا، قطر 
کلمات کلیدی محاسبات با کارایی بالا، الگوریتم BWA-MEM کیفیت خدمات، تعیین توالی نسل بعدی، مقیاس پذیری، عملکرد نرم افزار و موازی، بهره وری 
شناسه شاپا یا ISSN ISSN ۱۸۷۷-۷۵۰۳
رفرنس دارد
لینک مقاله در سایت مرجع لینک این مقاله در نشریه Elsevier
نشریه الزویر Untitled

 

مشخصات و وضعیت ترجمه فارسی این مقاله (Word)
تعداد صفحات ترجمه تایپ شده با فرمت ورد با قابلیت ویرایش و فونت ۱۴ B Nazanin ۱۸ صفحه
ترجمه عناوین تصاویر و جداول ترجمه شده است
ترجمه متون داخل تصاویر ترجمه نشده است
ترجمه متون داخل جداول ترجمه نشده است
درج تصاویر در فایل ترجمه درج شده است
درج جداول در فایل ترجمه درج شده است

 


  • فهرست مطالب:

 

۱٫ محاسبات با کارایی بالا برای بیوانفورماتیک ها
۲٫ بررسی مقالات
۳٫ بهینه سازی گردش کار برای برنامه های کاربردی بیوانفورماتیک
نشان گذاری و مفروضات
۴٫ متدلوژی
۵٫ نتایج و بحث
اعتبار سنجی نتایج
۶٫ کار آینده
۷٫ نتیجه گیری


  • بخشی از ترجمه:

 

۷٫ نتیجه گیری
گردش کار بهینه سازی ارائه شده به بهبود عملکرد نرم افزار بیوانفورماتیک کمک می کند و ما این بهبود را در عملکرد، مقیاس پذیری، استفاده از سیستم و بازده موازی با استفاده از محبوب ترین الگوریتم مسیریابی به نام BWAMEM نشان دادیم . ما از داده های ژنوم استاندارد که از Bio-پلنت دانلود شده برای آزمایش هایمان در سیستم High-end HPC با دو ساختار مختلف (اینتل و AMD) تا حدود ۶۴ هسته / گره استفاده کردیم. در نتیجه، بهبود عملکرد به ترتیب بر روی سیستم های اینتل و AMD با مقیاس پذیری ٪ ۳۹و ۶۷٪، تا ۶۶٪ و ۲۰۰٪، بهبود یافت، و بازده موازی به ترتیب تا ۲۸٪ و۳۹٪ در سیستم High-end HPC بهبود یافت. ما می توانیم کاربرد سیستمی را بر روی ساختار اینتل تا ۳۸٪ بهبود ببخشیم. نتایج بهینه ی به دست آمده با استفاده از استاندارد BamUtil معتبرسازی شدند و ما مشاهده کردیم که دقت نتایج در مقایسه با نتایج مبنا ۹۹٫۹۷٪ است. به طورخلاصه، بهترین QoS را می توان با استفاده از بهینه سازی گردش کار سیستماتیک ارائه شده ی ما برای برنامه های کاربردی بیوانفورماتیک بدست آورد.


  • بخشی از مقاله انگلیسی:

۷٫ Conclusion

The proposed optimization workflow helps to improve the bioinformatics application performance and we have demonstrated this improvement in performance, scalability, system utilization and parallel efficiency using the most popular BWAMEM alignment algorithm. We used a standard genome data downloaded from Bio-planet for our experiments on high-end HPC systems with two different architectures (Intel and AMD) up to 64 cores/node. As a result, the, performance was improved respectively on Intel and AMD systems by 39% and 67%, scalability extended to 66% and 200%, parallel efficiency improved by 28% and 39% in the high-end HPC systems. We were able to improve the system utilization up to 38% on Intel architecture. The optimized results are validated using the standard BamUtil and we observed 99.97% accurate results compared to baseline results. As a summary, the best QoS can be obtained using our proposed systematic workflow optimization for the bioinformatics applications.


 

 

دانلود رایگان مقاله انگلیسی + خرید ترجمه فارسی

 

عنوان فارسی مقاله:

بهینه سازی گردش کار عملکرد و کیفیت سرویس برای کاربرد بیوانفورماتیک درمحاسبات با عملکرد بالا

عنوان انگلیسی مقاله:

Workflow optimization of performance and quality of service for bioinformatics application in high performance computing

  • برای دانلود رایگان مقاله انگلیسی با فرمت pdf بر روی عنوان انگلیسی مقاله کلیک نمایید.
  • برای خرید و دانلود ترجمه فارسی آماده با فرمت ورد، روی عنوان فارسی مقاله کلیک کنید.

 

 

 

ارسال دیدگاه

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *