دانلود ترجمه مقاله يك بسته نرم افزاري مجتمع براي آناليز داده هاي علم ژنتيك جمعيت – نشریه Ncbi

• فهرست مطالب:

چكيده
مقدمه
روش هاي مربوط به داخل جمعيت
روش هاي بين جمعيتي
ويژگي هاي جديد در Arlequin 3
تركيب دو روش جديد براي برآورد فاز گامتي و فراواني هاي هاپلوتيپ:

• بخشی از ترجمه:

ويژگي هاي جديد در Arlequin 3
• نسخه ۳ Arlequin رويه هاي هسته اي محاسباتي و رابط در يك برنامه واحد نوشته شده در C براي محيط ويندوز را تركيب مي كند. رابط براي فراهم كردن كارايي بالاتر به صورت كامل مجددا طراحي شده است.
• تركيب دو روش جديد براي برآورد فاز گامتي و فراواني هاي هاپلوتيپ:
 الگوريتم ELB يك رويكرد Bayesian كاذب با هدف احياء فاز گامتي ژنوتيپ هاي مولتي لوكوس است و برآورد فراواني هاي هاپلوتيپ نتيجه فرعي اين فرايند است. آپديت هاي فاز برمبناي يك پنجره از مكان هاي ژني مجاور ساخته شده و اندازه پنجره بسته به سطح مكاني عدم تعادل لينكاژي متفاوت است.
 الگوريتم زيپ EM كه تعميمي از الگوريتم EM براي برآورد فراواني هاي هاپلوتيپ هست هدف آن برآورد ژنوتيپ هاي مولتي لوكوس فازبندي نشده است. برآورد فازهاي گامتي نتيجه فرعي اين فرايند هستند. اين الگوريتم بوسيله افزودن مكان ژني به صورت تك تك عمل مي كند و به تدريج طول هاپلوتيپ هاي بازسازي شده را توسعه مي دهد.

• بخشی از مقاله انگلیسی:

New features in Arlequin 3

• Version 3 of Arlequin integrates the core computational routines and the interface in a single program written in C++ for the Windows environment. The interface has been entirely redesigned to provide better usability. • Incorporation of two new methods to estimate gametic phase and haplotype frequencies: ◊ The ELB algorithm (Excoffi er et al. 2003) is a pseudo-Bayesian approach aiming at reconstructing the gametic phase of multi-locus genotypes, and the estimation of the haplotype frequencies are a by-product of this process. Phase updates are made on the basis of a window of neighbouring loci, and the window size varies according to the local level of linkage disequilibrium.

دانلود رایگان مقاله انگلیسی

خرید ترجمه فارسی مقاله