دانلود ترجمه مقاله تنظیم ژن در سطح رونویسی و پسارونویسی به وسیله ی RNA غیر کدکننده طولانی (ساینس دایرکت – الزویر ۲۰۱۷) (ترجمه ویژه – طلایی ⭐️⭐️⭐️)

تنظیم ژن در سطح رونویسی و پسارونویسی به وسیله ی RNA غیر کدکننده طولانی

Transcriptional and Post-transcriptional Gene Regulation by Long Non-coding RNA

چکیده

زمینه ی در حال ظهور RNA غیر کدکننده

تنوع lncRNA

چه میزان از ژنوم رونویسی می شود؟

عملکردهای lncRNA

تنظیم بعد از رونویسی توسط lncRNA

lncRNA به عنوان منبعی از میکرو RNA

lncRNA به عنوان تنظیم کننده ی منفی miRNA عمل می کند

تجزیه mRNA مستقل از miRNA

تنظیم رونویسی توسط lncRNA

lncRNA گذرا از تقویت کننده های فعال، رونویسی می شود

فعالیت شبه تقویت کننده ژن های lncRNA

تنظیم رونویسی توسط بکارگیری اصلاح کننده های کروماتین

نتایجی که اظهار شده اند

منابع

چکیده

پیشرفت های صورت گرفته در تکنولوژی ژنومیک در سال های اخیر منجر به کشف شگفت انگیزی شده و ژنوم به مراتب فراگیرتر از قبل مورد بررسی قرار گرفته است. بسیاری از ترانسکریپتوم های تازه کشف شده به نظر می رسد دارای RNA غیر کدکننده ی طویل (lncRNA) یعنی گروه ناهمگنی از رونوشت های غیر قابل تشخیص، هستند. درک عملکرد بیولوژیک این مولکول ها، چالش عمده ای است و در این مقاله ی مروری ما برخی از پیشرفت هایی که تا به امروز صورت گرفته است را مورد بحث قرار می دهیم. یکی از موضوعات مهم زیست شناسی lncRNA به نظر می رسد وجود شبکه ای از تعاملات با مسیرهای میکرو RNA (miRNA) است. نشان داده شده است که lncRNA هم به عنوان یک منبع و هم به عنوان یک تنظیم کننده ی مهاری miRNA عمل می کند. در سطح رونویسی، مدلی در حال ظهور است که به وسیله ی آن lncRNA با اتصال به کروماتین پل هایی را با DNA و پروتئین تشکیل می دهد و به عنوان داربستی برای تغییر کمپلکس های پروتئینی عمل می کند. چنین مکانیسمی می تواند توسط تنظیم حلقه زنی کروماتین، پروموتورها را به تقویت-کننده ها یا ژن های غیر کدکننده ی شبه تقویت کننده متصل کند و همچنین با هدایت کردن هیستون به سوی لوکوس های خاص آنها را اختصاصی می کند.

نتایجی که اظهار شده اند

در این مقاله ی مروری، ما عملکردهای بیولوژیکی بسیار متنوع lncRNA ها را توصیف کرده ایم که منعکس‌کننده ی انعطاف پذیری خود مولکول RNA است. ما یک مدل کلی ارائه دادیم که در آن این عملکردها ممکن است به طور گسترده به دو دسته تقسیم شوند: عملکردهایی که نشان دهنده ی تعامل با شبکه های میکرو RNA به منظور تنظیم بیان ژن در سطح بعد از رونویسی هستند و عملکردهایی که تعامل lncRNA با تقویت کننده ها، پروموتورها و کمپلکس های اصلاح کننده ی کروماتین برای تنظیم بیان ژن در سطح رونویسی را نشان می دهند. برخی از lncRNA ها مانند H19 به نظر می رسد در سطوح مختلف تنظیم ژن عمل می کنند. هنوز مشخص نشده است که آیا این یک پدیده ی کلی است یا خیر. در واقع، باید به این نکته توجه کرد که درک کنونی ما از lncRNA از مطالعات انجام شده بر روی تعداد کمی از lncRNA ها می آید و در حال حاضر مشخص نیست که آیا این گروه از lncRNA ها نماینده ی کل lncRNA ها هستند یا خیر. یکی از چیزهایی که احتمالا به نظر می رسد این است که ما شروع به درک بهتر این مولکول ها می کنیم؛ طبقه بندی خام آنها به ncRNA طویل و کوتاه باید برای منعکس کردن عملکردهای متنوع آنها تغییر کند.

Abstract

Advances in genomics technology over recent years have led to the surprising discovery that the genome is far more pervasively transcribed than was previously appreciated. Much of the newly-discovered transcriptome appears to represent long non-coding RNA (lncRNA), a heterogeneous group of largely uncharacterised transcripts. Understanding the biological function of these molecules represents a major challenge and in this review we discuss some of the progress made to date. One major theme of lncRNA biology seems to be the existence of a network of interactions with microRNA (miRNA) pathways. lncRNA has been shown to act as both a source and an inhibitory regulator of miRNA. At the transcriptional level, a model is emerging whereby lncRNA bridges DNA and protein by binding to chromatin and serving as a scaffold for modifying protein complexes. Such a mechanism can bridge promoters to enhancers or enhancer-like non-coding genes by regulating chromatin looping, as well as conferring specificity on histone modifying complexes by directing them to specific loci.

Concluding remarks

In this review we have described the highly diverse biological functions of lncRNAs, reflecting the versatility of the RNA molecule itself. We have proposed a general model in which these functions may broadly be divided into those representing an interaction with miRNA networks in order to regulate gene expression at the post-transcriptional level and those representing an interaction of lncRNA with enhancers, promoters, and chromatin-modifying complexes to regulate gene expression at the transcriptional level. Some lncRNAs such as H19 appear to act at multiple levels of gene regulation. It remains to be seen whether this is a general phenomenon. Indeed, it should be noted that much of our current understanding of lncRNA comes from studies of a small number of lncRNAs and it is presently unclear whether these are representative of the group as a whole. One thing that seems likely is that as we begin to understand these molecules better, the rather crude classification into long and short ncRNAs will need to be refined to better reflect their diverse functions.

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

تنظیم ژن در سطح رونویسی و پسارونویسی به وسیله ی RNA غیر کدکننده طولانی

Transcriptional and Post-transcriptional Gene Regulation by Long Non-coding RNA