دانلود ترجمه مقاله ترقی های اخیر در زمینه شبیه سازی اتمی در توالی یابی DNA – الزویر ۲۰۱۵

elsevier

 

دانلود رایگان مقاله انگلیسی + خرید ترجمه فارسی
عنوان فارسی مقاله:

ترقی های اخیر در زمینه شبیه سازی اتمی در توالی یابی DNA با جریان الکتریکی

عنوان انگلیسی مقاله:

Recent progress in atomistic simulation of electrical current DNA sequencing

 

 

مشخصات مقاله انگلیسی (PDF)
سال انتشار ۲۰۱۵
تعداد صفحات مقاله انگلیسی ۱۳ صفحه با فرمت pdf
نوع مقاله ISI
نوع نگارش مقاله مروری (Review Article)
نوع ارائه مقاله ژورنال
رشته های مرتبط با این مقاله زیست شناسی
گرایش های مرتبط با این مقاله ژنتیک، بیوشیمی
چاپ شده در مجله (ژورنال) حسگرهای زیستی و بیوالکترونیک – Biosensors and Bioelectronics
کلمات کلیدی توالی‌ یابی دی ان ای، نانولوله های کربنی، گرافن، شبیه سازی اتمی، انتقال الکترون کوانتومی، نانوحفره
کلمات کلیدی انگلیسی DNA sequencing – Nanopore – Carbon nanotubes – Graphene – Atomistic simulation – Quantum electron transport
ارائه شده از دانشگاه دانشکده انرژی، محیط زیست، آب و پایداری، موسسه پیشرفته علوم و فناوری، کره جنوبی
نمایه (index) MedLine – Scopus – Master journals – JCR
نویسندگان Han Seul Kim، Yong-Hoon Kim
شناسه شاپا یا ISSN ISSN ۰۹۵۶-۵۶۶۳
شناسه دیجیتال – doi https://doi.org/10.1016/j.bios.2015.02.020
ایمپکت فاکتور(IF) مجله ۹٫۵۲۰ در سال ۲۰۱۸
شاخص H_index مجله ۱۷۰ در سال ۲۰۱۹
شاخص SJR مجله ۲٫۵۵۳ در سال ۲۰۱۸
شاخص Q یا Quartile (چارک) Q1 در سال ۲۰۱۸
بیس نیست 
مدل مفهومی ندارد 
پرسشنامه ندارد 
متغیر ندارد 
رفرنس دارای رفرنس در داخل متن و انتهای مقاله
کد محصول ۹۸۶۲
لینک مقاله در سایت مرجع لینک این مقاله در نشریه Elsevier
نشریه الزویر

 

مشخصات و وضعیت ترجمه فارسی این مقاله (Word)
وضعیت ترجمه انجام شده و آماده دانلود در فایل ورد و PDF
کیفیت ترجمه طلایی⭐️
تعداد صفحات ترجمه تایپ شده با فرمت ورد با قابلیت ویرایش  ۳۴ صفحه (شامل ۳ صفحه رفرنس انگلیسی) با فونت ۱۴ B Nazanin
ترجمه عناوین تصاویر و جداول ترجمه شده است  
ترجمه متون داخل تصاویر ترجمه شده است  
ترجمه متون داخل جداول ترجمه شده است  
درج تصاویر در فایل ترجمه درج شده است  
درج جداول در فایل ترجمه درج شده است  
درج فرمولها و محاسبات در فایل ترجمه  به صورت عکس درج شده است  
منابع داخل متن به صورت فارسی درج شده است  
منابع انتهای متن به صورت انگلیسی درج شده است  

 

فهرست مطالب

چکیده
۱- مقدمه
۲- پس زمینه شبیه سازی توالی یابی DNA با جریان الکتریکی
۲-۱- عدم توازن نظریه تابع گرین در انتقال کوانتومی
۲-۲- کاربرد جریان الکتریکی در توالی یابی DNA
۲-۳- مواد الکترود و یا کانال
۳- توالی یابی DNA بر اساس الکترودهای فلزی
۴- توالی یابی DNA بر اساس نانولوله های کربنی
۴-۱- حالت I-B مبتنی بر الکترودهای نانولوله کربنی
۴-۲- حالات دیگر مبتنی بر الکترودهای نانولوله کربنی
۵- توالی یابی DNA بر اساس گرافن و نانوروبان
۵-۱- حالت I مبتنی بر الکترودهای گرافنی و نانوروبان گرافنی
۵-۲- حالت II مبتنی بر گرافن و نانوروبان گرافنی
۶- توالی یابی DNA بر اساس سایر مواد دوبعدی و ساختارهای ناهمگن واندروالس آن ها
۷- موضوعات مربوط به مطالعات محاسباتی
۸- چشم انداز
قدردانی
منابع

 

بخشی از ترجمه

چکیده

ما به بررسی پیشرفت های اخیر در زمینه توالی یابی DNA بر اساس اندازه گیری جریان الکتریکی عرضی پرداختیم. پیکربندی های دستگاه ارائه شده در ادبیات با توجه به ظهور انگشت نگاره مولکولی به صورت سیگنال های جریان عمده (حالت I) و یا آشفته (حالت II) طبقه بندی می شوند. پیکربندی میکروسکوپ تونل زنی روبشی و شکاف الکترود تونل زنی به حالت اول تعلق داشته حال آنکه نانوکانال های دارای نانوحفره جاسازی شده و یا فاقد آن به رده بندی حالت دوم تعلق دارند. مکانیزم های حسگری مولکولی حالت اول و دوم تقریباً به ترتیب با تونل زنی الکترونی و دریچه گذاری الکتروشیمیایی مطابقت دارند. تاکید ویژه ای معطوف مطالعات شبیه سازی کامپیوتری می گردد که نقش مهمی در پیدایش و گسترش این رشته داشته است. هم چنین ما بر نانومواد ابعاد پایین مانند: نانولوله های کربنی، گرافن و نانوروبان های گرافنی تاکید نمودیم که رویکرد جدید حالت دوم را امکان پذیر می نماید. در نهایت، مسائل متعددی در مطالعات محاسباتی پیشین مورد بحث قرار گرفته اند، که به جهت گیری های تحقیقاتی آتی در راستای شبیه سازی قابل اطمینان تر دستگاه های توالی یابی DNA با جریان الکتریکی اشاره می نماید.

 

۸- چشم انداز

اندازه گیری جریان الکتریکی عرضی نشان دهنده یک رویکرد توالی یابی DNA امیدوار کننده می باشد که قادر است به وضوح تک مولکولی بدون نشانگذاری و تقویت دست یابد. در توسعه آن، نظریه و محاسبات نقش مهمی را ایفا می نمایند. بدون اشاره به ایده اصلی، اغلب طرح هایی که شامل کربن و دیگر نانومواد ابعاد پایین هستند در ابتدا در مطالعات نظری مطرح شده اند. با توجه به پیچیدگی آزمایشات، ادامه این روند در این زمینه می تواند مورد انتظار باشد. با این حال، بدیهی است که به اقدامات بیشتری برای تحقق بخشیدن به شبیه سازی کامل و قابل اعتماد توالی یابی DNA با جریان الکتریکی عرضی نیاز می باشد. خاطرنشان می گردد که مسائل بالقوه حیاتی در مطالعات محاسباتی پیشین وجود دارند، به عنوان مثال از دست رفتن عناصر در مدلسازی و یا سطح شبیه سازی ناکافی (حذف رکن اصلی، پادیون، حلال ها، هندسه واقع بینانه الکترود و مولکولی، نوسانات حرارتی، فرآیند جهش نامنسجم، و غیره)، که منجر به نتیجه گیری متفاوت درباره سیستم های اساساً یکسان دستگاه می شوند. این امر به طور طبیعی ما را به سوی جهت گیری تحقیقات مطلوب آتی سوق می دهد. یک نمونه می تواند گنجاندن توصیف دقیق اثرات پیچیده زیست محیطی در یک روش محاسبه اصول اولیه انتقال بار باشد که شامل فرآیندهای جهش نامنسجم باز نیز می گردد.

 

بخشی از مقاله انگلیسی

Abstract

We review recent advances in the DNA sequencing method based on measurements of transverse electrical currents. Device configurations proposed in the literature are classified according to whether the molecular fingerprints appear as the major (Mode I) or perturbing (Mode II) current signals. Scanning tunneling microscope and tunneling electrode gap configurations belong to the former category, while the nanochannels with or without an embedded nanopore belong to the latter. The molecular sensing mechanisms of Modes I and II roughly correspond to the electron tunneling and electrochemical gating, respectively. Special emphasis will be given on the computer simulation studies, which have been playing a critical role in the initiation and development of the field. We also highlight low-dimensional nanomaterials such as carbon nanotubes, graphene, and graphene nanoribbons that allow the novel Mode II approach. Finally, several issues in previous computational studies are discussed, which points to future research directions toward more reliable simulation of electrical current DNA sequencing devices.

 

۸- Outlook

The measurement of transverse electrical currents represents a promising DNA sequencing approach that can achieve single-molecule resolution without labeling and amplification. In its development, theory and computation have been playing an important role. Not to mention the original idea, most proposals that involve carbon and other low-dimensional nanomaterials have been first put forward in theoretical studies. Considering the complexity of experiments, this trend can be expected to continue in this field. However, it is also clear much more needs to be done to realize the complete and reliable simulation of transverse electrical current DNA sequencing. We pointed out that there exist potentially critical issues in previous computational studies, e.g. missing elements in modeling and/or insufficient simulation levels (omission of backbone, counterions, solvents, realistic electrode and molecular geometries, thermal fluctuations, incoherent hopping process, etc.), which resulted in differing conclusions on basically identical device systems. This naturally points us toward desirable future research directions. One example would be incorporating accurate descriptions of complex environmental effects into a firstprinciples charge transport calculation method that also includes incoherent charge hopping processes.

 

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

 

 

دانلود رایگان مقاله انگلیسی + خرید ترجمه فارسی
عنوان فارسی مقاله:

ترقی های اخیر در زمینه شبیه سازی اتمی در توالی یابی DNA با جریان الکتریکی

عنوان انگلیسی مقاله:

Recent progress in atomistic simulation of electrical current DNA sequencing

 

 

ارسال دیدگاه

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *