دانلود ترجمه مقاله تجزیه مولکولی مریستم انتهایی ساقه نخود – نشریه NCBI

• فهرست مطالب:

 چکیده
مقدمه
مواد گیاهی و جداسازی RNA
توالی بندی EST و ساخت یک آرایۀ متعارف
آنالیز و حصول داده های ریزآرایه
RT و زمان واقعی و PCR
هیبریدشدگی در جای اصلی خود
نتایج و توضیحات
ویژگی ESTهای تولید شده
قلمروهای کارکردی SAM نخود
کشف ژنهای دارای بیان متفاوت با استفاده از آرایۀ اولیگونوکلئوتید ۱۲K نخود
مقایسۀ رونوشت های SAM و AM که به صورت متفاوت از هم بیان می شوند
امضای رونوشتی مشترک فعالیت مریستمی
ژن های اختصاصی مریستم رأسی
رونوشت های با بیان زیاد در SAM

• بخشی از ترجمه:

علاوه بر بررسی بیانمکانی ژن های مختصSAM، بیان ۵ داوطلب دیگر در جای اصلی خود که در مقایسه با سایر بافت ها دارای بیان غنی شده در SAM میباشند ، نیز مورد بررسی قرار گرفتند.
ژن های درگیر در آغاز اندام های جانبی: ژن های درگیر در آغاز پریموردیوم برگ در داده های آرایه ایی آورده شدهاست. نشان داده شده است که ژن های YABBY در آرابیدوپسیس و ذرت نقش کلیدی در آغاز و گسترش پریموردیوم برگ ایفا می کنند
(Bowman 2000، Eshed و همکاران ۲۰۰۴، Juarez و همکاران ۲۰۰۴). FG532839 که بر اساس مقایسۀ BLASTX ، ارتولوگ مفروض ژن YABBY5 آرابیدوپسیس است، در SAM بسیار بیان میشود(شکل ۷).

موضع یابی یا استقرار در جای اصلی نشان داد که این ژن عمدتا در پریموردیوم انباشته میشود(شکل ۹I). این نشاندهندۀ نقش محافظت شدۀ ژن های YABBY نخود در تشکیل اندام جانبی است. شفافیت بین نتایج  RT-PCRو داده های در جای اصلی خود به این حقیقت بر می گردد که ، در حالی که تلاش شد پریموردیوم برگ تا جایی که امکان دارد شامل SAM تشریح شده نشود، اما جوانترین پریموردیوم برگی رو به رشد از بین نرفت. بطوریکه شناسایی آن بر روی SAM در زیر میکروسکوپ تشریح کارمشکلی بود. ژن های مهم نشانه دهی سلول به سلول در رشد اندام جانبی نیز در این آزمایش شناسایی شدند.ویژگی های ژن ERECTA همانند پذیرندۀ نشانه دهی کیناز پذیرنده شکل که جزء نشانه دهی سلول به سلول مشخص شد(Torii و همکاران۱۹۹۶). توالی مشابهی از نخود که پیش بینی میشد کیناز like-ERECTA (FG531865) را رمزگذاری می کند در پریموردیوم جانبی بسیار بیان میشود(شکل ۹K).

• بخشی از مقاله انگلیسی:

Introduction The development of the shoot apical meristem (SAM) has attracted widespread attention during recent years as an excellent model for understanding stem cell maintenance during plant development. Meristems are considered to be a plant’s equivalent of stem cell niches which are the cellular microenvironments that provide signals to maintain stem cells in a slowly dividing and undifferentiated state (Bhalla and Singh, 2006; Singh and Bhalla, 2006; Scheres, 2007). Stem cells in the central zone of the SAM provide cells for continuous development of the aerial parts of the plant. Dividing cells, that leave the central zone, enter the flanking peripheral zone and can be recruited for lateral organ primordia, which involves rapid division and differentiation. The SAM is located at the tip of the growing shoot. Histological analysis of the SAM shows that it is highlypatterned and well-organized; one of the most obvious properties of the SAM is that it is made up of superimposed cell layers designated as L1, L2, and L3 (Satina et al., 1940). In general, L1-derived cell lineages form the epidermis, L2-derived cells develop into sub-epidermis cells like photosynthesizing and gametal cells, and L3-derived cells make up the internal tissues (Stewart and Burk, 1970; Szymkowiak and Sussex, 1996). Different plant species may organize their cell layers differently; for example, the SAM only contains two layers—the single-layered tunica (L1) and the corpus (L2) (Steffensen, 1968)—in maize, but four superimposed cell layers are present in birch (Rinne and van der Schoot, 1998). Extensive genetic investigations, especially in the model angiosperm Arabidopsis thaliana, have led to the identification of several key meristem regulatory genes. The regulatory interactions between these genes have been elucidated through genetic and molecular analyses. These key regulatory genes include CLAVATA3 (CLV3), WUSCHEL (WUS), and SHOOTMERISTEMLESS (STM) (Long et al., 1996; Mayer et al., 1998; Fletcher et al., 1999). WUS and CLV3 form a feedback regulatory pathway that sustains the stem cell pools (Schoof et al., 2000). The functions of CLV3, CLV1, and STM orthologues appear to be well conserved in monocot and dicot systems (Vollbrecht et al., 1991; Sato et al., 1996; Suzaki et al., 2004, 2006; Chu et al., 2006). At the same time, the STM-leading pathways maintain cells in the meristem indeterminate, which is analogous to the role of the CLV–WUS pathway (Clark et al., 1996; Lenhard et al., 2002). However, the CLV–WUS pathway appears to be less conserved than the STM pathway. The maize and rice WUS orthologues show obvious differences with Arabidopsis regarding their expression patterns (Nardmann and Werr, 2006). Another gene, ROSULATA in Antirrhinum, which is considered to be the counterpart of Arabidopsis WUS, also demonstrates different functions due to mutations, resulting in abnormalities in leaf arrangement and branching patterns (Kieffer et al., 2006). These results show that observations for Arabidopsis cannot always be extended to other species, including other dicot species. We are particularly interested in exploring the molecular basis of meristem functionality in legumes, which diverged from Arabidopsis approximately 92 million years ago (Eckardt, 2001). Moreover, legumes are the second most important family of crop plants—they are widely used as a food and feed source (Graham and Vance, 2003). Legumes are particularly important for sustainable agriculture because of their ability to fix atmospheric nitrogen. In this study, the focus was on the garden pea (Pisum sativum), a classic model species for crop and plant development studies. In addition, the availability of various developmental pea mutants (Singer et al., 2002; Foucher et al., 2003) makes this system amenable to genomics studies. In recent work, isolated SAM was used to generate cDNA libraries enriched in genes expressed in the SAM (Wong et al., 2008). In the present study, sequencing performed using these cDNA libraries allowed us to discover apical meristem-expressed genes. These sequences were used to make a 12K microarray to investigate the transcriptional repertoire of the pea SAM. Furthermore, the spatial expression pattern within the SAM was investigated for selected genes by in situ hybridization. Our results show that spatially limited gene activation or the repression of genes underpins meristem development and functionality. Our data also provide a catalogue of target genes that can be used for both reverse-genetics approaches and meristem cell-type specific markers. Materials and methods Plant materials and RNA isolation Garden pea (Pisum sativum) cultivar Torsdag was grown under greenhouse conditions. 10-day-old pea seedlings at the vegetative stage were used. Four different samples were harvested and these included the shoot apical meristem (SAM), dormant axillary meristem (AM), root apical meristem (RAM), and non-meristem tissue (NM; consisting of tendril, leaf, stem, and mature root tissues). Total RNA was extracted from each sample using the Qiagen RNeasy Mini Kit according to manufacturer’s instructions.

دانلود رایگان مقاله انگلیسی

خرید ترجمه فارسی مقاله