دانلود ترجمه مقاله طبقه بندی مجدد زیرگونه های کلاویباکتر میشیگانانسیس – Ncbi 2018

طبقه بندی مجدد زیرگونه های کلاویباکتر میشیگانانسیس

Re-classification of Clavibacter michiganensis subspecies on the basis of whole-genome and multi-locus sequence analyses

مجله بین المللی میکروبیولوژی سیستماتیک و تکاملی 

International journal of systematic and evolutionary microbiology

چکیده

توصیف Clavibacter Capsici SP.NOV. COMB. NOV

توصیف Clavibacter insidiosus comb.nov

توصیف Clavibacter nebraskensis comb. Nov

توصیف Clavibacter sepedonicus comb. Nov

توصیف Clavibacter tessellarius sp. Nov. comb. Nov

چکیده

اگرچه در ابتدا پیشنهاد شده بود که جنس Clavibacter همه باکتری های کورینه فرم فیتوپاتوژنیک حاوی دی آمینوبوتیرات B2γ در پپتیدوگلیکان را در بر می گیرد اما گروه بندی مجدد همه به جز یک گونه به درون جنس های دیگر منجر به ایجاد حالات جدید با اختصاصیت منفرد در جنس ها شده است. گونه های منفرد موجود در جنس، Clavibacter michiganensis، چندین زیرگونه دارد، که همگی از پاتوژن های گیاهی اختصاصی میزبان هستند. آنالیز کل ژنوم، بر اساس میانگین شباهت نوکلئوتیدی و هیبریداسیون DNA-DNA دیجیتال، و همچنین آنالیز توالی چند لوکوسی (MLSA) 7 ژن خانه دار، از ارتقا هر زیرگونه C. michiganensis به وضعیت گونه حمایت کرده است. بر اساس داده های کل ژنوم و MLSA، ما ایجاد دو گونه جدید و ۳ ترکیب جدید را پیشنهاد کردیم: Clavibacter Capsici sp. Nov., comb. Nov و Clavibacter tessellarius sp. Nov., comb. Nov., و Clavibacter insidiosus comb. Nov.,، clavibacter nebraskensis comb. Nov. و Clavibacter sepedonicus comb. Nov. .

توصیف Clavibacter tessellarius sp. Nov. comb. Nov

Clavibacter tessellarius (tes.sel.la‘ri.us. L. masc. n. tessellarius، یک مارکر سنگ موزاییک)

Basonym: clavibacter michiganense زیرگونه ی tessellarius، clavibacter michiganensis زیرگونه ی tessellarius (کارلسون و ویداور ۱۹۸۲)، داویس و همکارانش ۱۹۸۴٫

توصیف گونه ها، نسبت به توصیف آن به صورت clavibacter michiganensis زیرگونه ی tessellarius که توسط کارلسون و ویداور ۱۹۸۲ ارائه شده بود، متفاوت نبود (۲۰).

نوع سویه به صورت ATCC 33566T (= NCPPB 3664T=LMG 7294T) بود.

این تاکسونومی جدید نه تنها مشکل درازمدت بودن یک گونه ی منفرد درون یک جنس ایجاد شده را حل می-کند Clavibacter، بلکه همچنین یک راه حل عملی برای پاتولوژی گیاهی و مارکرهای سیاسی که با قرنطینه و پاتوژن های گیاهی تنظیم شده سروکار دارند را نیز فراهم می کند. C. michiganensis، C. sepedonicus و C. insidiosus پاتوژن های قرنطینه یا تنظیم شده هستند در حالی که C. capsici یک پاتوژن گیاهی جدید می باشد که برای آن، محدوده ی توزیع و ریسک برای کشاورزی باید ارزیابی شود. گروه بندی توصیه شده، و بنابراین یک فهرست علایم ساده تر، اسناد تنظیمی را پیچیده نمی کند و با دقت بیشتری واقعیت بیولوژیک را بازتاب می دهد.

Abstract

Although the genus Clavibacter was originally proposed to accommodate all phytopathogenic coryneform bacteria containing B2g diaminobutyrate in the peptidoglycan, reclassification of all but one species into other genera has resulted in the current monospecific status of the genus. The single species in the genus, Clavibacter michiganensis, has multiple subspecies, which are all highly host-specific plant pathogens. Whole genome analysis based on average nucleotide identity and digital DNA– DNA hybridization as well as multi-locus sequence analysis (MLSA) of seven housekeeping genes support raising each of the C. michiganensis subspecies to species status. On the basis of whole genome and MLSA data, we propose the establishment of two new species and three new combinations: Clavibacter capsici sp. nov., comb. nov. and Clavibacter tessellarius sp. nov., comb. nov., and Clavibacter insidiosus comb. nov., Clavibacter nebraskensis comb. nov. and Clavibacter sepedonicus comb. nov.

DESCRIPTION OF CLAVIBACTER TESSELLARIUS SP. NOV. COMB. NOV.

Clavibacter tessellarius (tes.sel.la¢ri.us. L. masc. n. tessellarius a mosaic stone maker). Basonym: Clavibacter michiganense subsp. tessellarius, Clavibacter michiganensis subsp. tessellarius (Carlson and Vidaver 1982) Davis et al. 1984. The species description is unchanged from its description as Clavibacter michiganensis subsp. tessellarius given by Carlson and Vidaver, 1982 [20]. The type strain is ATCC 33566T (=NCPPB 3664T =LMG 7294T ). This new taxonomy not only resolves the long-standing problem of having only a single species within the wellestablished genus, Clavibacter, but it also provides a practical solution for plant pathologists and policy makers dealing with quarantine and regulated plant pathogens. C. michiganensis, C. sepedonicus and C. insidiosus are quarantine or regulated pathogens of important agricultural crops in many countries, while C. capsici is a newly described plant pathogen for which the range of distribution and risk to agriculture need to be assessed. The revised classification, and accordingly a simpler nomenclature, uncomplicates regulatory documents and more accurately reflects biological reality.

تصویری از مقاله ترجمه و تایپ شده در نرم افزار ورد

طبقه بندی مجدد زیرگونه های کلاویباکتر میشیگانانسیس

Re-classification of Clavibacter michiganensis subspecies on the basis of whole-genome and multi-locus sequence analyses